林业应用系统是林业实现科学管理的基础。随着近年来国家林业管理改革的深入,管理部门的职能进行了重新调配并逐步细化,因此需要对林业应用系统中功能进行升级,从而满足现有管理部门职能改变的需要。本文将本体的原理运用在原有林业应用系统升级过程中,将原系统中的知识构建局部本体并聚合成全局本体,让原有信息能实现多平台之间共享,从而减少系统升级优化的周期。具体研究如下：(1)本文通过对林业应用系统的特征分析并结合主流的本体聚合方法,提出了林业应用系统三步走的本体聚合工程框架,首先建立林业应用系统局部本体,然后判断局部本体,最后聚合生成全局本体。(2)为了减少在局部本体构建阶段原有系统信息的误读和信息丢失,本文提出了中间实体法和XML进化法进行局部本体的构建。(3)本文分析了局部间本体结构异构和语义异构的生成原因和特点,并结合比较主要本体聚合方法后,选择本体映射方法解决局部本体异构问题。通过研究本体映射理论,本文设计了林业应用系统本体映射系统,其由本体提取、映射策略选择、映射法则选择、结果聚合、结果修正、用户交互器等六部分组成。本文建立了林业应用系统本体相似度计算方法及配套的映射规则。(4)在前期准备工作完成后,本文对林业应用系统局部本体进行了林业应用系统全局本体的研究,提出了局部本体范化、特征提取、映射重用、规则选择、规则判断、映射错误判断与优化、生成林业应用系统全局本体六个过程,并对每个步骤进行研究。(5)本文对本体聚合方法进行了评价研究,并对林业应用系统本体研究进行了展望,在指标化的评价方法、映射的自动化、局部本体构建等领域仍需要大量研究。