株高是水稻品种的重要农艺性状之一。因此株高基因的发掘研究和利用备受重视，对水稻株高基因进行定位具有重要意义。　　 本研究采用带有高秆基因的水稻单片段代换系W27-14-1-2-03-24与轮回亲本华粳籼74（HJX74）进行杂交得到次级分离群体，并利用次级分离群体对水稻株高基因进行定位，同时得到一批次级单片段代换系。研究表明杂交F1都为高秆，F2高秆植株与矮秆植株分离比经x2测验符合3：1。表明该株高基因受一对显性基因控制，暂时命名为PH-1（t）。采用SSR标记将该显性高秆基因首先定位于水稻第1染色体长臂PSM331和RM1068两个标记之间，遗传距离分别为0.6cM和0.9cM，且在这两对引物之间共找到了32株交换株。为了进一步精细定位该目的基因，我们扩大水稻分离群体，并利用PSM331和RM1068之间三个多态性标记对这32个交换株进行扩增，通过基因型和表性分析，把目标基因限制在RM11977和RM1068之间68kb的区间内。根据已知的水稻基因组全序列在水稻第1染色体上RM11977和RM1068之间的BAC序列上寻找微卫星序列，共设计了10对新的SSR引物。用这些SSR标记对亲本进行扩增，其中三个引物具有多态。通过进一步对RM11977和RM1068之间剩余的11株重组株进行分析。最终将基因PH-1（t）定位于RM11977和L06之间，物理距离为23kb。并通过水稻基因组注释系统（RiceGAAS）对RM1068和L06之间23kb的染色体区域进行了基因预测及功能分析。在这区域内发现含有5个ORFs，其中ORF3与赤霉素的合成有关，初步推测其为目标基因PH-1（t）。