2008年次贷危机后，各国金融业开始注重风险的防范，对于银行业的管理也逐步重视。但我国国有银行在长期内处于垄断地位，同时政府和中央银行通过各种计划性、行政性指令来替代商业银行可能做出的最优经济决策，导致商业银行的非理性的经济选择以及银行非优化的资源配置，其中银行的管理和资源配置能力是实现银行效率的关键。研究商业银行的市场结构及其影响因素，并对银行市场结构的垄断竞争程度与其效率之间的关系进行研究具有重要意义。本文以银行市场结构与效率理论为前提，选择指标对两者进行单独统计分析。在SCP理论的基础上对银行市场结构和银行效率的关系进行分析，并结合相关理论对两者之间的关系进行论证，在此基础上建立实证模型。其中银行市场结构变量选择市场集中度（CRn）、赫芬达尔指数（HHI）进行衡量，通过数据包络分析（DEA）法进行分析得出银行效率，根据分析结果选择综合效率对银行效率进行衡量。研究样本选取中国4家国有银行和12家代表性股份制银行并选取2004年至2012年作为研究区间。首先，进行银行市场结构的相关数据处理和分析；其次，利用deap软件对银行的投入和产出数据进行处理，得出银行效率；最后，eviews7.2对银行市场结构和银行效率数据进行回归，在回归前为保证实证结果的可信度对样本数据做了单位根检验和协整检验。根据理论分析和实证研究得出：第一，我国商业银行市场结构集中度水平都越来越低，说明我国商业银行从垄断型的市场结构逐步向竞争型发展；我国银行业高垄断高集中度的市场结构并不是因为各商业银行之间竞争所形成的，而是由我国政府和中央银行的政策指导所形成的。第二，银行效率总体上是属于上升趋势，综合效率和配置效率两者的走势基本一致，技术效率基本平稳，所以银行综合效率的提高，大部分是由于银行配置资源能力的提升。第三，银行效率并非影响市场结构的主要因素，但是商业银行市场集中度对银行效率有较强的负影响。所以，我国的市场结构的形成不是银行行为所导致的，而是行政性政策所引导的；如果想要改善市场结构，则需要通过改善银行管理方式，提高银行效率，进而达到降低市场集中度的目的。