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p53是一个重要的抑癌基因,在DNA损伤以及癌基因信号通路中,作为转录因子发挥关键调控作用。在受到DNA损伤、致癌基因的激活和低氧等刺激时,激活的p53蛋白可以调控一系列基因的转录,从而促进细胞周期停滞、DNA修复、细胞凋亡或衰老。miRNA是一类具有调控功能的内源性非编码RNA,可以通过碱基互补配对的方式识别靶mRNA,进而形成沉默复合体,并降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻译。许多研究发现,mi RNA参与调控p53信号通路,p53也可以反过来调控miRNA的转录或加工过程。由于越来越多的文献发现p53与miRNA之间的相互作用,为了系统地了解p53与miRNA之间的复杂关系,我们利用文献挖掘方法和第二代测序方法系统分析乳腺癌中p53相关的miRNA。首先,我们利用一种基于文献挖掘的方法-自然语言处理方法,来系统分析在乳腺癌中p53与mi RNA的相互作用,总共发现有22个miRNA与p53相关。随后用三个比较常用软件PicTar、miRanda和TargetScan来预测每个miRNA的靶基因,并用实验验证了部分miRNA的靶点。这22个乳腺癌中p53相关miRNA的靶基因一共有320个。基因本体论注释(GO)、KEGG分析和互相作用网络分析表明,大多数p53相关mi RNA的靶基因主要在细胞周期过程中富集,其次是参与轴突导向信号通路。另外,将p53 shRNA慢病毒及其对照病毒感染乳腺癌细胞系MCF-7,感染72小时之后,用嘌呤霉素进行筛选,获得稳定细胞株。通过第二代测序方法比较了p53干扰的细胞株和对照细胞株的小RNA表达谱,发现p53干扰之后导致12个miRNA的表达显著降低。并在Hek293细胞中过表达p53,通过实时定量PCR方法,发现其中5个miRNA表达显著升高。利用PicTar、miRanda和TargetScan来预测miRNA靶基因,一共预测到464个靶基因。利用Ingenuity pathway analysis软件分析,我们发现这些基因主要在轴突导向信号通路中富集,其次是细胞生长和增殖过程。本文的研究揭示了一个新的p53调控机制,即p53除了直接调控细胞周期和轴突导向信号通路中的基因转录以外,也可以通过调控miRNA的转录,从而间接地调控细胞周期和轴突导向信号通路。