地方政府因为掌握着绝对数量的社会资源,在区域一体化的过程中起着重要的作用:地方政府间通过合作,为各要素、资源的自由流动提供平台。但是现有研究表明,地方政府之间的合作往往是形式大于内容,常常会陷入“议而不决、决而不行”的困境。因此,本文选取了区域一体化背景下的地方政府合作这一问题,主要研究地方政府缘何合作、如何进行合作以及合作困境的产生原因。本文借助的理论工具是交易成本理论和制度性集体行动理论,将区域内地方政府的合作看作是多个地方政府通过交易实现自身利益目标和偏好的过程。各合作主体能否达成合作,不仅取决于合作能带来的收益,还取决于交易成本。通过完善相应的合作机制,可以有效节约交易成本,从而激励地方政府合作。基于此,本文提出了共同利益、资源互补和中央推动是导致地方政府合作产生的原因,并将合作机制划分为协商谈判机制、执行监督机制和问题解决机制,以此作为本文的解释性框架。本文的研究方法是案例研究法和比较分析法。本文将解释性框架带入长三角医保一体化中地方政府合作中进行验证。之所以选择该案例,是因为我国的医保政策是由市（县）层面进行统筹,医保一体化主要是地方政府主导的。地方政府的合作机制完善与否、合作水平的高低,对能否打破医保政策壁垒起到了决定性作用。为此,本文首先搜集、比较了长三角三省一市典型城市的医保相关政策;其次将长三角医保相关的联席会议与签订的协议和发布的政府文件进行了前后对比,从而归纳和总结了共同利益、资源互补与中央推动在长三角医保一体化进程起到了推动作用,并促使了地方政府合作机制的形成。本文的研究结论是:首先,我国区域一体化背景下地方政府合作是以共同利益、资源互补和中央推动为前提和基础的;其次,地方政府合作机制是由协商谈判、执行监督和问题解决机制组成的;最后,由于制度环境和组织文化,以及协商主体数量增加和地位不平等,地方政府机会主义倾向和能力水平差距,尚无明确法律制度约束和合作绩效尚未纳入考核等多种因素,导致了现阶段我国地方政府合作机制仍然无法有效发挥作用,合作的交易成本较高,难以激励地方政府参与合作。最后,本文借鉴了欧盟与美国的地方政府合作的经验,从而对健全我国地方政府合作机制提出了政策建议。