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目的:
1、通过收集一个患者的临床资料和生物样本,研究临床表型与致病基因之间的关系,构建基因型与表型关系谱,为临床诊断和遗传咨询提供参考。
2、定位致病基因和验证突变,丰富已有突变的数据库。
方法:
本研究对象为在温州医科大学附属育婴医院儿童康复科长期随访的一例患儿,首先进行病史采集。患儿是一名6岁9个月的女孩,系G1P1,父母体健且无血缘关系,两系三代均否认有遗传性疾病病史。患儿出生时即发现有双侧手足裂畸形,自幼语言发育迟滞,表达能力很差,且喜欢自娱自乐。其次完善体格检查及骨骼X线检查、头颅MRI、血生化、遗传代谢病氨基酸和酰基肉碱谱分析、α-甘露糖苷酶活性测定,以及其他评估神经系统发育的相关辅助检查。经知情同意,采集该家系2代成员(包括患者Ⅲ-1,患者父母Ⅱ-1、Ⅱ-2)的外周静脉血各2ml,从外周血白细胞中分离提取得到的基因组DNA,将患者Ⅲ-1的基因组DNA寄送至北京迈基诺基因科技有限责任公司,使用目标序列捕获技术进行基因捕获,应用Illumina Nextseq500高通量测序仪进行外显子组测序,经过生物信息分析后,最后对疑似突变位点通过Sanger测序进行验证和家系分析,确认突变。
结果:
1、患儿有严重的骨骼畸形(手足裂畸形),不仅有言语认知障碍,还存在沟通及社交障碍,结合ADOS测评结果,考虑存在典型性孤独症,患儿α-甘露糖苷酶活性远低于正常对照。
2、基因检测出患儿MAN2B1基因的第19号外显子上发生了复合杂合突变:([c.2993G>A]+[c.719G>A]([p.Arg998His]+[p.Arg240Gln])),目前尚未见到国内外有该突变的报道。
3、使用SIFT、Mutation_Taster和PolyPhen2等软件预测[c.719G>A]该突变位点有害。
4、通过生物信息学比对分析,MAN2B1基因在很多物种中该位点的核酸序列及其编码的氨基酸具有较高的保守性。所以,推测[c.719G>A]该位点的突变是造成该疾病的可能原因之一。
结论:
本研究报道了复合杂合变异([c.2993G>A]+[c.719G>A])在一名患有α-甘露糖苷贮积症的中国儿童中,该变异为MAN2B1基因的新发突变,该患儿出生时即有严重骨骼畸形而成活至学龄期,且本研究对象合并有孤独症。
1、通过收集一个患者的临床资料和生物样本,研究临床表型与致病基因之间的关系,构建基因型与表型关系谱,为临床诊断和遗传咨询提供参考。
2、定位致病基因和验证突变,丰富已有突变的数据库。
方法:
本研究对象为在温州医科大学附属育婴医院儿童康复科长期随访的一例患儿,首先进行病史采集。患儿是一名6岁9个月的女孩,系G1P1,父母体健且无血缘关系,两系三代均否认有遗传性疾病病史。患儿出生时即发现有双侧手足裂畸形,自幼语言发育迟滞,表达能力很差,且喜欢自娱自乐。其次完善体格检查及骨骼X线检查、头颅MRI、血生化、遗传代谢病氨基酸和酰基肉碱谱分析、α-甘露糖苷酶活性测定,以及其他评估神经系统发育的相关辅助检查。经知情同意,采集该家系2代成员(包括患者Ⅲ-1,患者父母Ⅱ-1、Ⅱ-2)的外周静脉血各2ml,从外周血白细胞中分离提取得到的基因组DNA,将患者Ⅲ-1的基因组DNA寄送至北京迈基诺基因科技有限责任公司,使用目标序列捕获技术进行基因捕获,应用Illumina Nextseq500高通量测序仪进行外显子组测序,经过生物信息分析后,最后对疑似突变位点通过Sanger测序进行验证和家系分析,确认突变。
结果:
1、患儿有严重的骨骼畸形(手足裂畸形),不仅有言语认知障碍,还存在沟通及社交障碍,结合ADOS测评结果,考虑存在典型性孤独症,患儿α-甘露糖苷酶活性远低于正常对照。
2、基因检测出患儿MAN2B1基因的第19号外显子上发生了复合杂合突变:([c.2993G>A]+[c.719G>A]([p.Arg998His]+[p.Arg240Gln])),目前尚未见到国内外有该突变的报道。
3、使用SIFT、Mutation_Taster和PolyPhen2等软件预测[c.719G>A]该突变位点有害。
4、通过生物信息学比对分析,MAN2B1基因在很多物种中该位点的核酸序列及其编码的氨基酸具有较高的保守性。所以,推测[c.719G>A]该位点的突变是造成该疾病的可能原因之一。
结论:
本研究报道了复合杂合变异([c.2993G>A]+[c.719G>A])在一名患有α-甘露糖苷贮积症的中国儿童中,该变异为MAN2B1基因的新发突变,该患儿出生时即有严重骨骼畸形而成活至学龄期,且本研究对象合并有孤独症。