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水稻黑条矮缩病毒(Rice black streaked dwarf virus, RBSDV)在日本侵染水稻引起水稻黑条矮缩病，玉米粗缩病毒(Maize rough dwarf virus, MRDV)在欧洲侵染玉米引起玉米粗缩病，研究表明两者在寄主范围和基因组S1，S4，S5利S6存在差异。为比较RBSDV玉米粗缩病分离物全基因组水平上的变异和分子进化，以湖北玉米粗缩病病毒分离物(RBSDV-Hbm)为材料，提取病毒dsRNA，克隆并测定了基因组S1，S4，S5和S6的全序列。其中S1全长4501bp，编码约168kDa的蛋白，结构分析它含有依赖RNA的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase, RdRp)特征性的GDD(Glycine-Aspartate-Aspartate)结构域和其它保守的区域。以RdRp的氨基酸序列为基础建立了相关呼肠孤病毒的进化关系。RBSDV-Hbm S4(AY160687)全长3617bp，含有一个阅读框，编码约135kDa的蛋白，同源性比较可以推测该蛋白可能是病毒的B突起(B-spike)结构蛋白：S5全长3164bp，除一个大的阅读框(ORF1)外，还可能有一个部分重叠的小阅读框(ORF2)，并且ORF2起始位置与RBSDV浙江水稻分离物(RBSDV-Zjr)不同；S6全长2645bp，编码约90kDa的蛋白，其与SMC和MAD蛋白有相同的保守域。 构建了RBSDV外壳蛋白P10的原核表达载体pGEX-P10，IPTG诱导后在大肠杆菌种表达。表达产物经Glutathione Sepharose 4B纯化后免疫家兔制备抗血清，分别建立了ELISA和Western blotting检测方法，成功地从病叶和灰飞虱体内检测到病毒，其中ELISA可以从健叶稀释液中检测到160ng的P10，病叶稀释到1／1280也可以与健康材料区分开。 用粗提纯的RBSDV病毒侵染水稻原生质体和小麦质壁分离的悬浮细胞。两天后用主要外壳蛋白P10和病毒非结构蛋白P6抗血清Western blotting检测，结果都呈阳性。用P10抗血清也证明了病毒粗提液能够直接侵染小麦悬浮细胞和愈伤。为验证提取的病毒基因组的侵染活性，分别设三种处理，即：ssRNA、dsRNA和ssRNA／dsRNA mix，脂质体包被后电击转染水稻原生质体，P8抗血清Western blotting检测结果呈阳性，表明病毒RNA在细胞内翻译产生了相应的蛋白。Northern blotting检测dsRNA和ssRNA／dsRNA mix转染的细胞结果呈阳性，ssRNA处理的结果呈阴性，证明病毒基因组dsRNA非常稳定，在细胞中不容易降解。该研究为建立反向遗传学体系打下了基础。