【摘 要】
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在本文中,我们对于基因表达谱数据的特点进行了研究,根据基因表达谱数据的特点提出了表达谱数据噪声过滤、数值规范化两个方法;然后对于k-means聚类方法在表达谱数据上的应用
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在本文中,我们对于基因表达谱数据的特点进行了研究,根据基因表达谱数据的特点提出了表达谱数据噪声过滤、数值规范化两个方法;然后对于k-means聚类方法在表达谱数据上的应用进行了深入的研究,并提出了一种确定分类数目的方法;结合以上的方法,我们提出了一种基于基因表达谱的疾病亚型的特征基因挖掘方法,其中,我们提出了一个衡量特征基冈对疾病亚型鉴别能力的测度:模式质量.该特征基因挖掘方法基于规范化和过滤后的基因表达谱,融合了k-means聚类识别疾病亚型技术和提出的衡量特征基因对疾病亚型鉴别能力的模式质量测度,实现特征基因挖掘.最后将提出的方法应用于40例结肠癌组织中2000个基因的表达谱实验数据,并将结果可视化,通过特征提取前后模式质量的比较以及可视化的结果显示:提出的方法是一种可行的疾病亚型特征基因挖掘方法,方法的优势在于可并行实现疾病亚型划分和特征基因识别.
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