基于干旱区内陆河流域的脆弱生态环境特征，提出了生态补偿机制构建的重要意义。在总结国内外研究进展的基础上，构建了流域生态补偿机制理论框架。研究认为生态补偿的研究既是热点又是难点，关键在于补偿主体、对象的界定和补偿标准的确定，而这两方面研究的基础是流域生态服务功能价值的评价。论文以塔里木河流域九大水系之一的渭干河流域为例，以1985和2000年两期遥感影像数据，新疆、阿克苏相关统计数据，水资源公报数据，1995～2007年国土资源调查数据，实地调研一手数据为基础，运用遥感与GIS、社会调查、数理统计等多种方法对流域上下游的生态服务价值进行评价，以此为基础构建渭干河流域多层次、多元主体、多种生态要素间的生态补偿机制。　　 主要研究内容包括：1)运用GIS的缓冲区分析，结合引力模型和场强模型计算出上游向下游的生态服务价值流转的范围的强度，2007年上游共溢出生态服务价值24.83亿元，向库车、沙雅和新和流转价值分别为2.81、6.42和15.6亿元；2)构建水资源边际效益模型与弹性模型，计算了2000～2006年农业灌溉用水投入与耕地生态服务价值产出之间的关系，农业用水每变化1％，生态服务功能价值变化约11.41％，而经济价值则变化约7％，上游灌溉用水的最大水量9.3×108～9.5×108m3，为流域水资源生态补偿标准的制定提供了依据；3)运用生态损益法、机会成本法及CVM方法，计算出上游应获得的最高补偿标准为24.83亿元，最低标准为0.24亿元，参考标准为7.1亿元；构建成本分担模型，计算下游县对上游机会成本损失的分担数额分别为库车2.11亿元，沙雅为1.82亿元，新和3.18亿元；4)运用情景模拟方法，引入Markov链对无补偿、现有补偿和充分补偿条件下的用地类型变化进行模拟分析，发现按照参考补偿标准进行足额补偿时，既能保障上游土地利用向有利于生态环境优化的方向发展，又可提高上游居民尤其是水源涵养区的农牧民收入水平，使流域的生态系统和社会经济系统更趋和谐。