【摘 要】
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RNA（Ribonucleic Acid,核糖核酸）是生命体中不可或缺的分子,承担着传递遗传信息,调控转录过程和催化反应发生等的重要功能,其功能的行使与在细胞中的定位息息相关。当前是一个信息爆炸的时代,在各种科学技术发展的推动下,越来越多的生命科学数据呈现指数式的增长,RNA亚细胞定位（RNA subcellular localization）领域也不例外。如何在这些纷繁复杂的数据中快速找到对研究
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RNA（Ribonucleic Acid,核糖核酸）是生命体中不可或缺的分子,承担着传递遗传信息,调控转录过程和催化反应发生等的重要功能,其功能的行使与在细胞中的定位息息相关。当前是一个信息爆炸的时代,在各种科学技术发展的推动下,越来越多的生命科学数据呈现指数式的增长,RNA亚细胞定位（RNA subcellular localization）领域也不例外。如何在这些纷繁复杂的数据中快速找到对研究最有利用价值的信息,是这个时代丞待解决的问题。为了应对科研人员的海量数据检索及分析需求,本研究基于超文本标记语言（Hyper Text Markup Language,HTML）、层叠样式表（Cascading Style Sheets,CSS）、JavaScript（JS）、超文本预处理器（Hypertext Preprocessor,PHP）、MySQL数据库和Smarty模版引擎构建了包含查询、浏览、下载和分析等丰富功能的资源平台—RNALocate v2.0。与以往版本相比,2.0版本扩充了 RNA相关的综合信息,实现了对于不同来源数据的有效整合,设计了最合适的信息展示方式,并嵌入了三种基于序列的RNA亚细胞定位预测工具。依托该平台,研究者能够利用丰富的RNA亚细胞定位综合信息深入探索其功能机制。海量信息的收集与整理是资源平台更新和维护绕不开的一环。在数据飞速增长的时代背景下,仅仅依靠人工完成这项工作是不切实际的。为了满足这一现实需求,本研究同时开发了相应的文本挖掘（Text mining）工具。该工具采用深度学习模型Albert结合Stacking集成学习方法（Stacking ensemble learning method）的策略,实现对文本中RNA、亚细胞位置和疾病三类命名实体的识别,并完成相应互作信息的提取,满足了快速从文献中筛选关键信息的要求。综上所述,本研究成功构建了 RNA亚细胞定位综合信息资源平台,开发出了针对这一特定领域的文本挖掘工具。未来,该工具将成为平台更新的得力助手,平台也将为工具的优化提供数据基础。二者相互配合形成良性循环,帮助探索RNA的亚细胞定位与功能机制的奥秘。
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