TRAF6对人结肠癌细胞全蛋白表达谱以及棕榈酰化蛋白表达谱的影响

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:spirithero
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
结肠直肠癌(CRC)是目前亚洲第三大恶性肿瘤,因其高发病率和死亡率成为世界范围内的主要健康问题。揭示结肠癌的癌变机制显得尤为重要。肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)是一种衔接蛋白,在多种癌症中高度表达,并在肿瘤的发生发展、侵袭以及转移方面起着重要的作用,但其在人结肠癌中的作用鲜见报道。目的运用基于SILAC技术的定量蛋白质组学考察TRAF6对人结肠癌细胞全蛋白表达谱和棕榈酰化修饰蛋白表达谱的影响,并从蛋白整体水平及蛋白翻译后修饰水平探索TRAF6调控人结肠癌细胞发生发展的分子机制。方法1、运用q PCR和Western blot技术分别在m RNA和蛋白水平上对已构建的稳定敲减TRAF6的HCT116细胞株中TRAF6的敲减效率进行验证。2、运用基于SILAC技术的定量蛋白质组学考察TRAF6对人结肠癌细胞全蛋白表达谱的影响。3、运用生物信息学软件分析人结肠癌细胞中TRAF6介导调控的差异蛋白所参与的生物过程、分子定位、生物功能和信号通路。4、运用分子生物学技术对主要参与的信号通路进行生物验证。5、以野生型人结肠癌细胞HCT116细胞为研究对象构建基于SILAC和点击化学的棕榈酰化修饰蛋白组的定量分析方法。6、采用构建成功的基于SILAC和点击化学的棕榈酰化修饰蛋白组的定量分析方法对TRAF6调控人结肠癌细胞的棕榈酰化修饰蛋白质组进行定性和定量分析并鉴定其棕榈酰化位点。7、运用生物信息学软件对人结肠癌细胞中TRAF6介导调控的差异表达的棕榈酰化蛋白进行GO注释分析。结果1.基于SILAC的定量蛋白质组学分析TRAF6对人结肠癌细胞全蛋白表达谱的影响,发现TRAF6在人结肠癌细胞中参与调控了胆固醇的生物合成通路。2.在人结肠癌细胞中TRAF6的敲减促进了胆固醇生物合成通路中关键蛋白HMGCS1和FDFT1的表达,不仅升高了人结肠癌细胞内总胆固醇水平,还诱使更多的胆固醇转移至质膜,使得质膜中的胆固醇水平亦明显升高。3.在人结肠癌细胞中TRAF6下调介导胆固醇水平的提高与LDLR介导的外源性胆固醇的摄取,SREBP2介导的胆固醇合成通路中关键蛋白的转录调控,ACSS2介导的乙酰Co A的合成和ABCA1介导的胆固醇外排的调控机制无明确相关性。4.运用NEM修饰替换疏水性棕榈酰化修饰链,结合基于SILAC和点击化学的定量蛋白质组学分析方法,成功实现对棕榈酰化修饰蛋白的定性定量分析和对棕榈酰化蛋白修饰位点的鉴定。5.运用上述建立的棕榈酰化修饰蛋白的分析方法,研究了TRAF6对人结肠癌细胞中棕榈酰化修饰蛋白表达谱的影响。从中筛选出27个蛋白的棕榈酰化修饰程度发生变化。这些蛋白多定位于细胞膜,主要参与细胞-细胞之间的粘附、m RNA稳定性的调控、m RNA分解代谢过程的正调控、NIK/NF-?B信号通路、葡萄糖代谢过程等生物过程。这些生物过程多伴随于结肠癌发生发展、侵袭和迁移的过程中。结论1.TRAF6抑制胆固醇的生物合成通路,通过降低细胞内胆固醇水平,重塑脂筏结构,进而影响与结肠癌发生发展的蛋白在脂筏中的定位及下游信号传导,最终影响人结肠癌细胞的生长、增殖、侵袭和迁移。2.TRAF6通过介导信号蛋白的棕榈酰化修饰过程参与到与结肠癌发生发展相关联的生物过程中,如细胞与细胞间粘附、葡萄糖代谢等生物过程。
其他文献
雾霾是一种比较常见的天气现象,在这种天气情况下拍摄的图像普遍存在质量较低的问题,如对比度下降、细节丢失等,从而给后续的图像处理和分析带来很大的困难。因此,为了在雾霾天气获取高质量的图像,需要对有雾图像进行去雾处理,以提高图像的对比度,丰富图像细节,保证计算机视觉系统在雾霾天气下的正常运行。对有雾图像的去雾研究主要分为两类:一类是采用图像增强的方法,另一类是基于物理成像模型的方法。采用图像增强的方法
推进马克思主义大众化,就必须不断对人民群众进行马克思主义理论以及马克思主义中国化成果的教育,让人们群众掌握马克思主义理论,并能够将学到的理论运用于实践活动,指导实践活动。本文着眼于中央苏区的社会教育,通过对中央苏区社会教育的研究,深刻认识中央苏区社会教育对马克思主义大众化的贡献,总结其现实启示和借鉴意义。全文包括以下五个部分:第一部分:为绪论部分,包括选题背景和选题意义、文献综述、研究内容和研究方
红砂作为超旱生小灌木,是荒漠地区分布最广泛的植物之一。通过抗旱性综合评价,筛选出影响评价抗旱性的关键指标及抗旱性优良的红砂家系,完善早期选择方法,为优良抗旱性红砂家系的选育和育种材料的推广提供科学依据,以期为我国红砂等灌木类植物进行家系早期选择提供一种可靠的方法。本实验于武威市凉州区育苗建立试验地,分别在2014、2015、2016、2017、2018年七月份,以红砂家系(即2a、3a、4a、5a
在信息化时代,微博和网购平台在人们的日常生活、学习和交流中发挥着越来越重要的作用,平台上的用户数据隐藏着丰富的情感信息。与此同时,这些海量的数据也吸引着越来越多的研究者参与到微博和网购等短文本数据的研究,如何有效表示短文本语义特征和深入地挖掘短文本潜在的情感信息是其中的重点和难点。传统机器学习方法使用的特征在向量空间模型上表现过于稀疏且缺乏短文本的语义信息,不能很好地识别短文本的语义特征和潜在的情
近十年来,硫化铅(PbS)量子点太阳能电池的效率进展主要受益于电子传输层(ETL)和量子点活性层的改进和优化,对空穴传输层(HTL)的研究相对较少。目前主流的高效电池器件均采用
苇岸是当代生态散文的开拓者和杰出代表。他在短暂的12年散文创作生涯中只留下近20万字的作品,但他潜心探究自然与人类共同体的亲缘关系,写出以《大地上的事情》《一九九八:廿四节气》为代表的一批生态散文精品,成为生态文学研究的一个典型对象。生态意识一直是苇岸散文研究的核心命题。针对已有研究大多未能把生态意识与审美价值有机结合起来进行综合研究的存在问题,本文试图从生态审美的视角综合考察苇岸散文的生态书写,
近年来,随着人们对环境保护和食品安全的重视,传统的养殖模式弊端逐渐显露。早期粗放型的养殖模式为了提升养殖产量,无视环境承载力,过度追求高密度养殖,大量增加投饵,致使病
钢管混凝土组合构件由于其优异的力学性能,在工程中有广泛的应用。常用的钢管混凝土组合构件截面形式为圆形和方形,最近几年矩形截面的研究与应用也有很大发展。本文从组合受
目的本研究通过对比针刀松解术与电针两种疗法,对骨间背神经卡压综合征患者运动功能改善情况、神经电生理指标变化、肌电图改善效果等方面的影响,综合评估两种疗法治疗本病的临床疗效,寻找治疗本病的有效疗法,为本病临床疗效的提高提供新思路。方法严格按照诊断标准及纳入标准并通过排除标准,筛选研究时间段内于武汉市中医医院针灸科门诊及病房就诊的符合本次研究的骨间背神经卡压综合征患者32例,采用随机数字表法以1:1的
高速公路类REITs目前是我国高速公路公司新型的公路融资模式。其主要基于高速公路收费权之上,通过产生的现金流量作为收益来源来发行的一种资产支持专项计划。由于我国高速公路建设资金需求大,资金回转周期长,单一的资金来源无法满足庞大的公路建设资金缺口,因此在大力推进基建公募REITs的背景下,收费公路成为重点支持行业。伴随着新型高速公路融资模式的快速推进,其面临的融资风险问题和相关法律政策不完善的问题逐渐显露。对这种新型的高速公路建设融资模式进行风险研究,具有一定现实意义。本文