生境片段化是指大的、连续的自然栖息地被划分为更小的、孤立的、空间上互相隔离的小斑块的一种景观尺度下的过程。栖息地的片段化效应将会导致栖息地的空间结构发生改变,如适宜的栖息环境逐渐减少,栖息地斑块逐渐增多、以及栖息地之间间隔距离增加等等。近期,由于全球经济的快速发展,人为活动干扰造成的片段化生境越来越多,已经成为全球生物多样性下降的一个重要原因。关于人为活动造成的生境片段化研究的逐渐深入,发现从不同空间和不同时间尺度下进行研究,则能更好的解释生境片段化对物种遗传多样性的影响,能为物种的保护提供更为可靠的科学依据,并制定更有效的保护措施。而与陆地生境岛屿系统相比,陆桥斑块与大陆具有相同物种库,并且其生境斑块具有边缘明显、隔离基质单一、形成时间一致以及景观格局清晰等优势,因此,在陆桥斑块上研究生境片段化的影响更为理想。本研究以分布广泛的花臭蛙为研究对象,通过不同生境下花臭蛙的遗传多样性和遗传结构的对比,揭示生境片段化对花臭蛙的影响;另外,采用不同的分析方法来剖析历史气候变化和近期片段化对花臭蛙种群基因流的影响。从而准确而全面的了解近期生境片段化对花臭蛙的影响,为生物多样性的保护提供更为可靠的科学依据。本文主要研究结果如下:1、本文主要研究通过9对微卫星引物来分析花臭蛙14个岛屿种群和7个陆地种群的遗传多样性和遗传结构。结果显示.:岛屿种群的遗传多样性(AR=5.71;NA=7.29;HE=0.70)要明显高于陆地种群(AE=4.97;NA=6.51;HE=0.68);岛屿种群(Fs.r=0.051)和陆地种群(FsT=0.087)都表现为显著的遗传结构,岛屿种群间的遗传分化要略低于陆地种群,而近交系数值(FIs=0.325)高于陆地种群(FIs=0.028),且全部都显著表现大于0。分子变异分析(AMOVA)的结果显示虽然岛屿和陆地的花臭蛙种群间都存在遗传分化,但是它们遗传变异的主要来源还是种群内,并且岛屿种群间(5.07%)的遗传变异要低于陆地种群(8.72%)。STRUCTURE软件的分析结果显示,花臭蛙种群一共聚为5个遗传簇,陆地种群被分为2个遗传簇,岛屿种群被分为3个遗传簇。BayesAss软件检测到岛屿种群间(mBay<0.014)和陆地种群间(mBay<0.029)的当代基因流水平都比较低,并且岛屿种群间的基因流速率要略低于大陆种群间的基因流速率。在Bottleneck软件中Wilcoxon sign-rank的检验结果显示:在IAM模式下,岛屿种群中有4个种群存在瓶颈效应,陆地种群没有发现;在TPM模式下,岛屿种群中有7个种群存在瓶颈效应,陆地种群中有3个种群存在瓶颈效应;在SMM模式下,岛屿种群中有8个种群村在瓶颈效应,陆地种群中有3个种群存在瓶颈效应。在AFD检测中发现,只有04种群发生了变异,说明在04号种群经历了种群下降,但也有可能是该种群正在恢复受建群(foundereffect)作用的影响。2、基于不同时间尺度的遗传数据分析技术的方法对岛屿生境中花臭蛙种群的基因流进行分析。结果显示:花臭蛙种群间在过去和现代都存在较广泛的基因流,但是BayesAss软件的分析结果显示,花臭蛙岛屿种群间的现代基因流水平都比较低(0.001-0.174),而Migrate-n的检测结果发现所有的岛屿种群间的历史迁移率在4.139-115.501范围,要显著高于岛屿种群现代的基因流水平。另外,还发现种群07和14的现代基因流来源有限,并且07和13种群的基因流的主要来源是种群14,但是在种群的历史基因流的检测中种群07、13和14的基因流来源广泛,并且种群之间的基因流没有显著的差异。种群的净迁移率结果显示花臭蛙种群历史的净迁移率有7个种群的净迁移率为负值,7个种群的净迁移率为正值。而种群现代的净迁移率只有一个种群的净迁移率为负值(14),其它种群的净迁移率均表现为正值。