本试验收集了7个省市的46份甜瓜材料,其中包括来源于黑龙江省的材料18份,河南8份、辽宁4份、吉林8份、北京3份、天津2份、山东2份、山西的材料1份,分别对其进行SSR分子标记检测,并根据遗传距离开展聚类分析,共配置组合F1代28个,选用50对SSR特异引物对亲本进行检测,探索用亲本间遗传距离来预测F1杂种优势的可行性,为甜瓜杂种优势的利用以及亲本的选配提供参考。对46份甜瓜材料进行SSR标记分析,46对特异引物获得了稳定,丰富的多态性谱带。扩增谱带分子量在250bp-1750bp之间,合计187条谱带中有130条谱带具有多态性(占69.52%),平均每个引物可扩增出3.729条带。根据聚类分析的结果,将46份甜瓜材料分为9类,在9类中又选取22个具有代表性的材料,重新进行聚类分析后22份材料被分为四类,在这22份材料中有些材料间的遗传距离非常近。在22份材料中选择11个亲本,配置18个F1代,根据18个组合六个性状杂种优势与相应亲本间遗传距离绘制成二维坐标散点图,在整体糖酸比的离亲优势与遗传距离相关分析中出现了二次曲线显著相关,在A组中只有糖酸比的离亲优势遗传距离均表现相关显著;在B组分析中,果肉厚度的离亲优势与遗传距离相关极显著,可溶性固形物的离亲优势与遗传距离相关极显著。因此说明,利用聚类结果选配亲本要因作物和品种而异。因此,需要进一步探讨杂种优势与基因表达的关系。