PEP、DOP-PCR单细胞多基因位点检测研究

被引量 : 0次 | 上传用户:ansunyou
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
植入前遗传学诊断(Preimplantation genetic Diagnosis,PGD)通过体外辅助受精、胚胎细胞遗传学分析,选择正常胚胎移植,能将人类遗传病控制推进到胚胎植入子宫内膜之前,避免了异常妊娠的发生,具明显的遗传优生学意义。但由于PGD的分析材料仅限于1-2个活检卵裂球细胞,单细胞多聚酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)和荧光原位杂交(Fluorescencein-situ hybridization,FISH)能提供的遗传信息非常有限,难以满足同时检测多个基因位点或重复检测的需要。 全基因组扩增(Whole genome amplification,WGA)技术通过扩增微量DNA模板甚至单个细胞的整个基因组,再将扩增产物分为多份,作为模板,进行后续分析,增加微量DNA分析的遗传信息量。应用于PGD,实现了单次胚胎活检,可分析多种不同基因病或多次重复检测同种基因病。WGA技术主要有扩增前引物延伸(Primer extension preamplification,PEP)、退变寡核苷酸引物PCR(Degenerate oligonucleotide primer-PCR,DOP-PCR)。PEP以随机组成 2001年浙江人学帧十学位论义 的 15碱基寡核昔酸作为引物,在低温下连接、延伸,随机扩增整个基因组 DNA。 DOP—PCR引物序列为 5’-CCGACTCGAGN’N’N’NNNATGTGG-3’,经低温引物 随机连接和常温特异引物连接延伸两步法扩增,按比例均匀扩增整个基因组 D「A。?2P和D0?-?[R的随机引物众多,单一循环的PCR条件无法使所有随机引 物同时处于良好的复性和延伸状态,其扩增全基因组DNA的完整性和扩增效率 尚存许多亟待探讨之处。 单细胞PEP用于检测基因位点的研究国外开展较早,迄今已有利用PEP 进行性别、神经节昔脂病GM。I型、口地中海贫血.、IU:ln血型、高度多态短串 联重复序列(short tandem repeat,STR)等基因位点的研究,但尚未见p地中 海贫血 CD17和 nt-28突变基因及连锁基因(An?rlyl?T)、18和 ZI号染色体特异短 串联重复序列 D18551、D21511和 D2151411位点的报道。国内研究才刚刚起步, 仅徐晨明和王敏分别进行单个淋巴细胞、单个胚胎细胞和单个胎儿有核红细胞 的杜氏肌营养不良症基因的检测。单细胞DOP-PCR全基因组扩增产物目前局 限于比较基因组杂交,检测全基因组或染色体组缺失和重复,应用于基因病的 检测报道甚少。若能在DOP-PCR全基因组扩增,CGH染色体非整倍体检测的 同时,利用其DOP-PCR产物,开展基因病的检测或筛查,将具有明显的临床 应用价值。 第一部分 单细胞PEP多基因位点检测的研究 目的:探索建立单细胞PEP全基因组扩增,后续巢式PCR 6地中海贫血 CD17和 nt-28突变基因及连锁基因(ATTTTTT)、18和 21号染色体短串联重复序 列 D18S51、D21Sll和 D2lS1411位点检测技术,考察单细胞陀P同步检测上述 基因位点以及囊性纤维病CF A F508及连锁基因(GATT)、杜氏肌营养不良症DMD 2 2001年浙江人学J袖十学位论义基冈外显子尸和48、Y染色体性别决定基因SRY的扩增准确率,分析单细胞陀P扩增全基【间mA的完整性。方法:显微操作获取单个人淋巴细胞和胚胎细胞,PEP全基回组扩增,后续特异性巢式PCR,检测上述川个基囚位点的单细胞扩增率(特异产物扩增出现的比率)、假阳性率(阴性管内山现扩增产物的比率)、假阴性率(川性管内未出现扩增产物的比率)。扩增准确率(单细胞利阴性、川性扩增产物的符合率)。结果:1.成功建立单细胞陀P全基回组扩增,后续巢式 PCR D地中海贫血 CD17 t[ nt-28突变基因及连锁基因 (ATI”TT)、18和 21号染色体短串联重复序列 D18551、D21511和 D2151411位点检测技术。2.成功进行单细胞PEP-巢式PCR,上述基因位点以及缀性纤维病CF八F508及连锁基因(GATTTT)、杜氏肌营养不良症皿D基因外显子17和48、Y染色体性别决定基因 SRY 10个位点的同步分析,单个淋巴细胞和单个胚胎细胞扩增准确率分别达97.17%(583/600)和 gi.58%(174/190)。3.单个淋巴扩增PEP后续巢式PCR扩增准确率高于单个胚胎细胞,假阳性率低于胚胎细胞,两者有显著性差异(P<0.05)。 第二部分 单细胞DOP-PCR多基因位点检测的研究 日的:探索建立单细胞DOP-PCR全基因组扩增,后续巢式PCR上述10个基冈位点的同步检测技术?
其他文献
旋风分离器已广泛用于中小型循环流化床(CFB)锅炉,但对大型CFB锅炉则有诸多问题。过去用于中小型出过不少问题,有的问题尚待解决。介绍国内外气固分离器的结构及使用情况,并提出选
荀子(约公元前298—前238年)是我国先秦时期一位集百家思想之大成的唯物主义哲学家和教育家。荀子学识渊博,一生的主要时间从事教学,他的思想中有丰富的教育心理思想。他的教育
本文通过土壤培养和框栽试验,探讨了硫磺与磷矿粉配合施用肥效方面的问题。并从“可持续发展”角度看待我国磷肥资源,在发展高效复合磷肥的同时,根据我国的磷矿资源和土壤条件,生
阅读课程是大学英语教学中的重要组成部分。尤其是在英语通行的今天,大学生毕业后,阅读成为他们获取信息的重要手段,所以,英语教师需要在课堂上进行行之有效的阅读教学以提高学生
CAD技术的应用使产品设计、制造的工作内容和方式发生了根本性的变革,并成为工业发达国家制造业保持竞争优势、开拓市场的重要手段。数字制造作为一种新的制造概念引起了制造
本文以对比语言学的一般理论和方法为指导,对比了两词在表达疑问和非疑问用法时,在句法、语义、语用层面上的相同点和不同点,并试图寻找造成差异的原因。本文共分五章:第一章是绪
中国作家老舍是一位勤奋而多才多艺的作家,与现代文学史上的许多著名作家一样,他的创作与生活与中国和西方文化有着密切的联系。 本文从中西方文化这一独特的视角来观照老舍
沉积盆地内部的火山岩是研究盆地形成的构造环境以及探讨盆地发展演化的动力学特征的重要线索。松辽盆地具有二元结构特征,断陷构造层发育大量的火山岩。但是,前人尚未对此进
<正> 近视眼是一种最常见的屈光不正,祖国医学称之为“能近怯远症”。近视眼的防治,是目前眼科界乃至整个医学界所重视的一个重要课题。国内和国外的专家调查结果均表明:随着