基于TCGA数据库探究NRP-1在胃癌中的作用及机制

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目的胃癌作为一种常见癌症,一直严重威胁着人类的身心健康。随着胃癌基因层面的研究进展,研究表明神经纤毛蛋白1(Neuropilin1,NRP-1)在胃癌发生、发展中起重要作用。本研究通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库分析NRP-1在胃癌组织中的表达以及其与患者预后的相关性,同时采用我院胃癌组织进行验证,探究其NRP-1的表达及其与患者病理特征以及预后之间的关系。方法从TCGA数据库中下载胃癌相关数据,分析胃癌组织较癌旁组织差异表达的基因,分析验证NRP-1在数据库是否差异表达以及其差异表达是否与患者预后相关;回顾性分析2009年4月—2010年4月在我科采取手术治疗的109例胃癌患者临床病理资料,采用免疫组化方法检测胃癌及癌旁组织中NRP-1的表达水平,然后进一步分析NRP-1表达与患者临床病理特征以及和预后之间的关系。结果基于TCGA数据库中胃癌数据分析,NRP-1在胃癌中较正常组织高表达(18.19:6.65)且NRP-1的表达与患者预后具有相关性(P<0.05);验证试验中,109例患者,61例患者胃癌组织NRP-1高表达,48例低表达;在正常组织中,11例高表达,98例低表达,两组之间差异有统计学意义(P<0.05)。由统计学分析可知,患者胃癌组织NRP-1的表达在年龄及性别差异方面无统计学意义(P>0.05);随着肿瘤直径大于等于50mm及小于50mm分组,肿瘤直径大于等于50mm组胃癌组织NRP-1的表达率明显增加(P<0.05);病理分期pT1/T2与pT3/T4组之间NRP-1的表达差异有统计学意义(P<0.05),且随着分期增加,其表达增加;NRP-1的表达随着淋巴结阳性数的增加,表达也明显提高(P<0.05);且肿瘤组织学方面,低分化或者未分化组较高分化或者分化组,NRP-1的高表达率明显增加(P<0.05);NRP-1的高表达与肿瘤直径、原发灶情况、是否有淋巴结转移、淋巴结转移个数以及组织学分化程度相关(P<0.05);COX回归(比例风险模型)多因素分析结果显示NRP-1的表达情况是影响胃癌患者预后的独立危险因素(P<0.05)。结论通过TCGA数据库分析,NRP-1在胃癌组织中差异表达,且这种表达差异与患者预后具有相关性。临床验证得出,NRP-1在胃癌的进展中对肿瘤起到促进作用,其高表达与胃癌的恶性生物学行为相关;NRP-1的高表达与胃癌患者的生存率成负相关,NRP-1可能作为一种用于预测胃癌患者预后的肿瘤标记物。
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