目前,我国把研发投入作为一项战略性投资,大幅度增加研发投入,超前部署和发展战略技术和产业,抢占制高点。研发投入是否能增加社会知识总量,提升整个社会的科技水平,获得科技竞争优势来促进经济增长,关键要看研发投入的效率如何。不同的企业研发费用的绩效存在差异,合理配置资金,最大限度地提高资金的使用效率意义重大。研发活动是高新技术企业发展的源泉,对增强企业竞争力、使企业持续高速增长起到极为关键的作用。随着我国市场经济的纵深发展,研发活动的意义将更为重大。通过恰当而科学的对研发费用进行绩效研究,可以总结经验教训,为今后的研发投资政策和管理提供参考,并使企业认识到研发活动创造的价值所在,从而进一步增强企业加大研发费用投入的动力,提高企业研发费用投入的有效性。本文在梳理国内外高新技术企业研发费用绩效的相关理论及研究成果的基础上,针对国内外研究成果中的不足和局限,采用数据包络分析(DEA)方法,对30家高新技术企业研发费用绩效进行比较分析,得出一些有价值的分析结论,并相应提出高新技术企业应加大研发费用投入力度、优化投入产出结构、加强研发费用使用的监管和绩效考评等方面的政策建议,进行更加全面客观的评价研发费用绩效,进一步完善研发活动的绩效评价体系,以提高研发费用的优化配置效率,从而提高高新技术企业的核心竞争力。本研究对于高新技术企业研发费用绩效的提高和持续健康稳定发展具有积极的意义,提出的对策建议具有可操作性,体现了一定的创新性。