基于线粒体Cyt b基因探讨皖南山区花臭蛙种群遗传变异及其种群历史

来源 :安徽师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:water15
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
花臭蛙(Odorranaschmackeri)隶属蛙科(ranidae)、臭蛙属(Odorrana),是中国臭蛙属中分布最广泛的物种。该物种在皖南与凹耳臭蛙、武夷湍蛙、大绿臭蛙等物种同域分布。为比较分析小尺度地理格局中,不同物种对景观及其变化的响应策略。本实验利用线粒体Cytb基因作为分子标记,对皖南花臭蛙6个局域种群132个样本的遗传变异初步研究,并将研究结果与同域分布的其它蛙类进行比较分析,探究在相同景观格局中不同蛙类的遗传多样性、种群间遗传分化模式及其种群历史。主要结果如下:
  实验测定皖南花臭蛙132个样品Cytb基因全序列(1146bp),共检测到49个变异位点,点定义了43个单倍型。基于Kimura2-paramete模型的单倍型间遗传变异距离变化范围为0.1%-0.7%,其碱基差异范围在0.087%到0.61%。花臭蛙6个种群总的线粒体单倍型多样性指数(h)为0.762(局域种群变化范围为0.58-0.91),核苷酸多样性(π)0.00115(局域种群变化范围为0.0009-0.00163)。
  基于AMOVA的分析结果显示,花臭蛙种群线粒体遗传变异主要发生在种群内,种群间的遗传分化系数Fst=0.00658(p>0.5)。成对种群间遗传分化的比较结果显示,除水阳江的程坑和青弋江的桃岭种群间产生了显著的遗传分化外,其余种群间均未检测到显著的遗传分化。MantelTest检验结果显示,皖南花臭蛙6个种群间的遗传分化与采样地点间的地理距离没有明显的相关性(r=-0.181,p=0.766)。
  基于ML和Bayes分析结果显示,皖南花臭蛙线粒体Cytb单倍型均未产生独特的进化支,单倍型网络图呈星形暗示皖南花臭蛙种群很可能经历了历史扩张事件。中性检验,Fu’sFs和Tajima’sD的均为显著的负值,进一步证实皖南花臭蛙历史上发生了种群增长和区域扩展。单峰形的歧点分布曲线同样支持上述结果。BSP分析显示,皖南花臭蛙在末次冰期后(距今1.9-1.5万年前)经历过种群增长。
  比较分析发现,皖南花臭蛙线粒体遗传多样性明显低于同域分布的其它蛙类,但种群间的遗传分化程度最低,种群间存在较强的基因流。
其他文献
基质细胞衍生因子-1(SDF-1)和其受体CXCR4的结合可以引起多种细胞的迁移。CXCR4的高表达与白血病的发展有关。另外,白血病的复发与白血病细胞的浸润关系密切。白血病细胞的迁移是浸润的关键步骤。因此,研究SDF-1和CXCR4结合引起的信号转导过程中的关键蛋白对白血病细胞迁移的影响对于揭示白血病迁移的机制具有重要意义。非受体酪氨酸激酶在细胞表面受体引起的信号向下传递过程中发挥关键作用。ABL
学位
谷物食品是人类最重要的主食和膳食营养的来源。已有研究表明谷物是较好的丝状真菌固态发酵培养基,固态发酵是有效的提高谷物营养价值和抗氧化性的手段。巴西蘑菇(Agaricus blazei)和双孢蘑菇(Agaricus bisporus)隶属于蘑菇属,不仅具有很高的营养价值,还有一定的保健功效。目前关于巴西蘑菇和双孢蘑菇的研究主要围绕栽培及其子实体,尚未发现将这两种菌接种于整粒的谷物培养基上进行固态发酵
学位
金属硫蛋白(Metallothionein, MTs)是一类低分子量,富含Cys的超家族蛋白,能够通过巯基的螯合作用结合金属离子发挥解毒功能,通过巯基的氧化作用消减ROS降低对细胞的氧化损伤,同时参与必需金属离子的平衡代谢调节,在细胞增殖、凋亡、衰老等一系列生理生化反应过程中发挥重要作用。  嗜热四膜虫(Tetrahymena thermophila)是一种单细胞真核生物,由于缺乏细胞壁,对外界环
衰老是老龄化社会持续关注的社会和经济学问题之一,也是目前生物医药领域研究的热点。国际医学学术界公认:生命最可怕的对手是衰老,衰老危害着人类的健康,是众多疾病的高风险因素。过度老龄化问题是对世界人口的另一个严重威胁。医学界将衰老分为生理性和病理性两类,前者是事物存在的规律,是生命过程中不可避免的自然现象,而后者则由各种内外因素使生理发生变化,导致疾病发生,加速衰老。病理性衰老是抗衰老医学预防的重点,
学位
飞蝗Locustamigratoria是世界性的重要农业害虫,具有迁飞性和暴发性,对农业生产造成巨大损失.细胞色素P450存在于细菌、原生生物、植物、真菌及动物等多种生物体内,参与生物体诸多重要的生命活动.细胞色素P450作为昆虫体内重要的解毒酶参与植物次生代谢物、杀虫剂等外源物质的代谢.本文利用RNAi、Real-timePCR、HPLC、UPLC-MS等多种生化和分子生物学理论和技术对飞蝗细胞
学位
RNAi(RNA interference)是dsRNA介导的一种转录后基因沉默现象,RNAi技术自发现以来已被广泛应用于基因功能的研究,近年来国际上普遍认为基于RNAi的害虫防治技术在植物保护领域具有潜在的应用价值。然而,昆虫RNA干扰效率的差异在很大程度上制约着这一技术在害虫控制中的应用。影响RNAi效率的因素有很多,dsRNA在血淋巴和中肠液中的稳定性是影响RNAi效率最关键的因素。本文重点
学位
目的:核糖体合成调节蛋白1(human regulator of ribosome synthesis 1, RRS1)是参与核糖体生物合成的重要蛋白,其主要功能是招募5SRNP的各组分(RPL11、RPL5及5sRNA)进入初期核糖体,参与Pre-rRNA的加工并调控核糖体的生物合成,与人类疾病的发生、发展密切相关。近年来,RRS1在肿瘤中的作用日益受到关注。乳腺癌是目前全球女性发病率最高的恶性
学位
中心体作为动物细胞一种重要的细胞器及主要的微管组织中心,其在细胞中的数目较稳定:间期一个分裂期两个。中心体在细胞间期和分裂期担负的作用不同:细胞间期中心体对于维持细胞的极性、细胞形态及细胞的运动至关重要;分裂期主要参与分裂极的形成以保证遗传物质准确分配到子代细胞中。中心体畸变尤其中心体数目扩增(中心体扩增)对细胞正常生命活动影响巨大,往往会导致细胞分裂无法正常进行,进而导致染色体无法正常分配到子代
学位
灰胸薮鹛(Liocichlaomeiensis)是我国特有珍稀鸟类,仅偶见于我国四川省中南部和云南省东北部的少数山区森林中,因种群数量稀少、分布区狭窄和生境破碎化严重被IUCN列为全球性易危(Vulnerable)物种。为加深对该物种的认识,本论文自2016年至2017年,在四川老君山国家级自然保护区、四川省峨眉山风景区和四川省瓦屋山自然保护区,对灰胸薮鹛的鸣声和活动区进行了初步研究。主要结果如下
学位
本文以树麻雀(Passermontanus)为对象,通过研究四川盆地内、外种群形态特征差异与遗传结构,探讨四川盆地的陆地岛屿效应。我们测量了分布于四川盆地及周边地区的558只成年树麻雀的7个形态特征并对其与海拔、纬度的相关性进行了分析,结果显示:  (1)按照地理区位划分的四川盆地北部、西部、东南部以及四川盆地内等多个树麻雀种群在体质量(P<0.05)、翅长(P<0.01)有极显著差异,跗跖(P<
学位