为建设创新型国家,目前政府在科研上的经费投入持续上升。作为科研领域的主力军,高校本应将科研经费用于科研事业,但是,近年来高校科研经费使用中的贪污腐败案件却屡禁不止。另外,高校科研经费内部控制制度不切合实际,导致科研人员工作效率低下。因此,选择H省内的某杰出高校——HN大学作为研究对象,探究该校的科研经费内部控制制度,并针对其中不完善的地方提出优化方案,这对于减少高校科研经费使用中的贪污腐败现象,促进高校科研事业的繁荣,推动国家的科技进步和经济增长都具有重要的现实意义。本文在参考大量国内外文献,借鉴内部控制、风险管理、委托代理、全面预算管理、绩效评价、业务流程再造等理论的基础上,首先对HN大学的科研经费收支概况以及内部控制的具体情况进行深描。其次,结合目前的情况对HN大学科研经费管理的重要环节中出现的问题进行了深入分析,发现了以下三个方面的问题,包括申请环节,预算编制不准确不专业;使用环节,预算实施和预算编制之间有明显偏差;决算环节,内部监督不严格,缺乏有针对性的激励制度。随后,通过研究发现导致上述问题的重要原因是HN大学的控制环境不适宜,风险评估制度不足,控制活动存在薄弱环节,内部信息与交流不顺畅,监督与评价体制不完善。最后,针对以上问题及其原因,设计了HN大学科研经费内部控制体系的优化方案。优化完成后,从信息沟通效率、预算编制主体、预算编制时长、经费支出控制力度、项目决算主体等方面对优化前后的效果进行对比分析,以便检验上述优化方案的实践意义。本文从以下五个方面对HN大学科研经费内部控制体系提出了优化方案:第一,优化控制环境完善相关制度;第二,建立风险评估制度;第三,通过设计课题立项、预算编制、预算调整、经费支出和决算与绩效考评等环节的流程图来改善控制活动的相关流程;第四,通过搭建科研信息共享平台和财务一体化平台来促进信息交流与沟通;第五,通过创新性地构建基于平衡计分卡理念下的科研经费绩效评价指标体系来完善内部监督与评价体系。采用这一系列的优化方案,期望能避免科研经费相关的贪污腐败案件,推动学校科研事业欣欣向荣,并为其他高校的科研经费内部控制制度建设提供参考借鉴。