目前我国正处于经济转轨和社会转轨的过程中，在改革开放力度不断加大，经济技术快速发展的形势下，不可避免地因为各类矛盾和问题引发不同程度的危机事件。从领域、频度、规模等维度来看，我国现阶段处于危机事件的多发期。在各类危机事件中，公共卫生领域的突发事件发生的频率和负面影响位居前列。如何有效应对这些危机事件，对我国政府来说是一个迫切需要解决的现实问题。近年来突发公共卫生事件的高频发生深刻揭示我国应对该类事件危机管理能力的乏力与缺失。对照现有体制，我们遗憾地发现，目前我国尚未建立应对综合性危机以及突发公共卫生事件的危机管理体系。本论文以突发公共卫生事件的危机管理为研究对象，综合应用比较管理学、危机管理理论、博弈论、委托－代理理论、绩效评估技术和数据统计分析方法，对构建政府突发公共卫生事件危机管理组织体系进行了研究。主要内容如下：首先，在研究分析美国和英国突发公共卫生事件危机管理系统基础上，总结了其成功经验对我国的有益启示。研究划分了西方发达国家的公共卫生管理发展阶段，得出我国处在相当于初级阶段的结论。第二，采用数据统计分析法和比较管理学，研究分析我国在公共卫生投入、公共卫生运行模式方面的失误，通过分析我国应对SARS危机的过程，揭示了我国在突发公共卫生事件危机管理方面存在的缺陷。第三，在研究分析国外危机管理现实经验基础上，阐述了政府构建突发公共卫生事件危机管理机构的构建原则，并结合我国危机管理现状，研究构建了完整的危机管理组织体系，包括：综合性危机管理常设中枢机构、公共卫生领域危机管理协调机构、以及基于ICS思想的危机管理指挥中心组织模式。第四，应用委托－代理理论和博弈论模型，对构建政府危机管理组织体系进行分析，研究了该组织的激励和约束机制。第五，通过对国内外政府绩效评估理论和应用现状的研究，基于危机管理的特点，在结合我国国情基础上，对建立多重绩效评估主体和异体问责制进行研究，并应用平衡计分卡思想和AHP－多层次模糊综合评测技术，建立了政府危机管理组织的绩效评估模型。