我国事业单位情况十分复杂，在事业单位改革过程中，营利性事业单位可谓改革幅度最大，难度也最大。从将事业单位按照预算方式划分为全额拨款单位、差额拨款单位、自收自支单位，到按照公益性和营利性划分为营利性事业单位与非营利性事业单位经过了一个漫长的时期，新的划分方式表明了国家对事业单位改革的思路更加清晰、方向更加明确。营利性事业单位的改革自上世纪八十年代中期开始，在此二十年的时间里，国家和地方颁布了许多政策文件，中央和地方从理论到实践均进行了有益的探索，编制管理和聘用制改革、创新标准的分类改革、触及产权的体制改革等使得营利性事业单位向企业化方向日益贴近。在改革实践中，营利性事业单位由于自身固有的特点与改制转企的目标之间存在比较大的距离，因此改革的进展受到多种影响，表现为一些难以突破的困境，例如观念保守人为拖延改革、措施不配套激发潜在矛盾、区域与行业不平衡以及时间的滞后性增加改革难度等。在研究这些困境的基础上，本文提出营利性事业单位必须充分认识自身相对于市场经济要求的不足，在坚信改制转企正确方向的前提下，深入解决观念问题、体制问题、生存能力问题等一系列问题，从深化聘用制改革、触动产权改革、建立现代企业制度、加强内部管理、提高市场竞争能力、完善配套措施、为职工解决后顾之忧等方面着手，切实有力地推进事转企改革。同时，作为对维护社会全面和谐发展富于责任的政府，要正确理解营利性事业单位转企的困难，实事求是面对现实，帮助转企事业单位减轻历史包袱，允许平稳过渡，尊重其自主权，将营利性事业单位向市场经济的大道上扶上马送一程，促进其健康持久发展。