1999年澳门回归中国之后,按照“一国两制”的基本国策,澳门特别行政区高度自治,在特区范围内实行原资本主义法律制度,而内地实行中国特色社会主义法律制度,两地虽然同属一个主权国家,但实际上形成了“一国两制两法域”的复杂状况。同时,随着两地交往的逐渐加深,两地之间人员、经贸往来日益密切,造成两地互涉刑事案件时有发生,两地司法机关依据各自的法律制度在对互涉刑事案件行使刑事管辖权时往往会产生管辖权的冲突。在此背景下,在理论上和司法实践中厘清内地与澳门两地的刑事管辖权问题,对于有效解决两地管辖权冲突变得及其重要。为此,本文从两地刑事管辖权冲突的现状入手,对其具体表现、特征、成因等要素进行梳理分析,提出了解决管辖权冲突应当坚持的四个基本原则,即维护国家安全和两地社会秩序原则、犯罪地管辖为主原则、先理优先原则和平等协商原则,并在此基础上就管辖权冲突的解决创新性地提出了分阶段处理的意见,即从长远来看通过中央立法彻底解决问题的模式、从中期来看以构建协调委员会或轮值法官解决问题的模式和从当前来看以广东为试点通过签订协议来解决问题的模式。