行政公益诉讼从开展试点到全面铺开以来,案件数量逐年攀升,再加之全社会环境保护的意识不断加强,逐渐产生了环境行政公益诉讼这一分支。在环境行政公益诉讼案件越来越频发的大趋势下,司法实践中检察机关调查取证中问题纷纷暴露出来,这些问题给检察机关的调查取证工作带来了不小的阻碍。本篇论文整体依托“提出问题-分析问题-解决问题”的研究思路,采用文献研究法和实证分析法进行研究。通过指出目前环境行政公益诉讼检察机关调查取证存在的问题并进行分析,最终提出完善建议。第一部分按照检察机关调查取证的行为逻辑这一主线,对调查取证的方式、内容、证明标准、特点及价值分别进行剖析,梳理调查取证基本脉络;第二部分开展实证分析,对五大案例进行梳理,两大案例进行具体展示的方式提炼出目前检察机关调查取证工作的现状,并简要指出存在的问题;第三部分详细论述环境行政公益诉讼检察机关调查取证存在的三大问题:一是调查取证对象消极配合,二是调查取证鉴定机构程序不统一,三是调查取证能力较为薄弱;第四部分分析调查取证问题的三大成因是缺乏强制性规定、鉴定相关制度缺失、缺乏技术保障;第五部分提出完善路径:一是针对调查取证对象消极配合提出建立联合保障体系和赋予检察机关调查取证适当刚性的建议。二是针对调查取证鉴定机构程序不统一提出确立从重且从先原则和建立国家性检察机关环境公益鉴定中心。三是针对检察机关调查取证能力较为薄弱提出丰富调查取证方式、提高业务素养、加强与群众证据线索联系以及设立专家辅助人制度。