新型农村合作医疗制度是我国医疗卫生制度改革的重要组成部分,是党中央、国务院为增强农民抵御大病风险的能力、努力让农民病有所医,保护农民身体健康、促进农村经济发展和社会稳定做出的重大决策,对构建社会主义和谐社会具有重大意义。新型农村合作医疗制度从2003年试点以来已基本覆盖全国农村。随着新农合的全面推进,基金的规模越来越大,监管任务也越来越重,在实际工作中遇到了很多问题,我们已经认识到新农合基金能否管好用好是新农合医疗制度长效运行、可持续发展的关键,为了进一步完善新型农村合作医疗制度,研究在实际工作中遇到的基金管理问题就显得十分必要。本文就内蒙古新型农村牧区合作医疗基金管理的现状和存在的问题进行研究,并提出应对策略。强化内部控制系统将有助于降低管理风险、提高运营的效率和效果、确保财务的可靠性。新型农村合作医疗存在医疗资金的筹集、使用等经济活动,因此需要有相应的内部控制制度,以便确保新农合医疗资金的安全及正确使用。本文将运用内部控制理论研究内蒙古新农合基金筹集、支付和监管三个方面的基金管理问题,内部控制与基金管理过程中的每一个细节都相关,内部控制的有效与否直接关系到基金管理的有效与否,也直接关系到新型农村合作医疗制度目标的实现。针对新农合基金筹集、支付和监管三个方面的问题,运用COSO内部控制框架构建了相应的内部控制体系,以期利用各种控制手段防止和减少新农合基金使用中不合理问题的发生。