辣椒(Capsicum annuum L.)原产于拉丁美洲热带地区,是一种重要的蔬菜和调味品,是我国的五大蔬菜之一。由于传统辣椒的育种限制于种内,所利用的基因越来越集中到少数种质上,因此随着品种的不断更新,遗传基础变得越来越狭窄,虽然育成的品种很多,但在培育新品种方面受到很大限制。空间诱变育种是一门新兴的育种技术,在植物诱变育种中有广泛的应用前景。本研究对通过空间诱变而获得的辣椒品种：宇椒一号(宇一)、宇椒二号(宇二)、宇椒三号(宇三)及其原始对照(未进行空间搭载材料)进行形态学研究,利用AFLP分子标记技术进行了分子检测,并对检测到的差异片段进行克隆、测序和分析,同时对辣椒叶片总蛋白进行双向电泳分析,得到结果如下：1.辣椒品种宇一、宇二和宇三与其对照相比在农艺性状上都有所改变,宇一及宇三的株高比其对照均高,宇二比其对照略矮；叶片的形状变化不大；宇一与宇二与其对照相比叶片颜色上无太大变化,商品成熟期均早于对照,宇三比其对照叶片颜色略深,商品成熟期比对照晚；三个实验材料在单株结果数及鲜果重均比其对照均多,根的直径也比其对照略粗。2.实验优化了适合空间诱变辣椒的AFLP体系,根据该体系用100对通用引物对三个实验品种的基因进行差异表达的分析,共得到318条差异表达条带,将其回收、克隆后送去测序,共得到179个特异表达条带,将GSSs进行测序分析,一共获得了68条已知功能的基因并用GO软件进行功能分类。通过对已知功能基因的进一步分析,得到了空间诱变后的GSSs。3.通过蛋白双向电泳技术,宇一与其对照比较分析后得到差异点共有91个,其中具有显著差异的共22个,表达量上调的18个,下调的4个；宇二与其对照比较分析后得到差异点共74个,其中具有显著差异的共12个,表达量上调的11个,下调的1个；宇三与其对照比较分析后得到差异点共90个,其中具有显著差异的共36个,表达量上调的30个,下调的6个。将其中具有显著性特异表达的39个蛋白质斑点进行质谱鉴定及数据库搜索,得到的序列经生物信息学手段分析得出其具体的功能。