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单核苷酸多态性(SNP)是近年来被认为最有发展潜力的第三代分子标记。本实验室利用Illumina RNA-seq技术,从淀粉含量、薯干产量和茎线虫病抗性差异明显的徐781和徐薯18测序结果中已获得1,386个SNP候选位点。为开发实用的SNP标记,本研究采用等位基因特异性PCR(AS-PCR)和四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)两种特异性扩增的方法以及酶切扩增多态性序列(CAPS)酶切的方法,检测候选SNP位点,确定合适的甘薯SNP分子标记检测方法,对其反应条件进行优化,包括反应退火温度、内外引物浓度之比和Taq DNA聚合酶用量,并根据候选SNP位点,设计引物,检测SNP位点和开发SNP分子标记。主要研究结果如下:1.通过AS-PCR、Tetra-primer ARMS-PCR和CAPS三种常用的SNP检测方法,对甘薯SNP位点进行检测,比较其检测可行性和有效性,并对适宜检测方法的反应体系进行优化。结果表明,Tetra-primer ARMS-PCR方法能准确、快速检测甘薯SNP位点并进行分型,操作步骤简单,费用低廉,使用25μL的反应体系,在每一组引物的最适退火温度下,内外引物浓度之比为0.4μmol/L:0.2μmol/L,Taq DNA聚合酶用量为1.25 U时,可以达到良好的检测效果。2.利用徐781和徐薯18转录组测序获得的候选SNP位点共设计了153组Tetra-primer ARMS-PCR引物,对徐781和徐薯18候选SNP位点进行检测,其中103组引物的PCR产物有差异,差异检出率为67.97%。研究结果表明,Tetra-primer ARMS-PCR适合甘薯SNP分子标记的检测,可以用于甘薯SNP分子标记的开发。Tetra-primer ARMS-PCR不要求特殊的设备,操作步骤简单,能准确检测甘薯SNP位点,费用低廉,该方法能有效地检测甘薯SNP位点和开发SNP标记,可以用于甘薯分子连锁图谱的构建和实用SNP标记的开发。