注射用丹参总酚酸是天士力集团研制的治疗缺血性脑血管病一种中药新药，主要成分为丹参经现代提取工艺得到的水溶性酚酸类成分，在治疗急性脑缺血方面具有良好的临床疗效，但其治疗物质基础及机理研究尚不够深入。为了明确其治疗急性脑缺血的药效物质基础及作用机理，本研究引入整合化学物质组学的整体系统生物学研究思路及技术，对其进行了化学成分、基因、代谢等不同水平上的研究。　　 首先我们采用化学物质组学(Chemomics)的研究思路，对其化学成分进行系统的研究。利用超高效液相色谱串联二极管阵列检测器(UPLC/DAD)构建了注射用丹参总酚酸的指纹图谱，并采用超高效液相色谱-电喷雾离子源-四极杆/飞行时间串联质谱(UPLC-ESI-Q/TOF)分别对指纹图谱中的14个共有指纹峰进行了定性分析。本方法可用于综合评价注射用丹参总酚酸的整体质量，为药物的质量评价和控制提供了科学依据。　　 其次，我们利用基因组学研究思路，采用博奥大鼠全基因组表达谱芯片，对丹参总酚酸治疗局灶性脑缺血大鼠缺血脑组织基因表达谱的影响进行了研究，从基因角度系统探讨其防治急性脑缺血缺血的作用机制。结果显示丹参总酚酸可以通过调控急性脑缺血大鼠466条基因，47条通路防治脑缺血损伤，涉及能量代谢、细胞凋亡、粘附因子表达、信号转导，细胞通讯等多个方面。　　 同时本研究以实验动物血液为研究对象，测定不同组间动物内源性代谢产物的变化情况，采用主成分分析法对所获得的代谢组学数据进行分析，并对潜在的生物标记物依次采用TOF-MS精确分子量测定、匹配分子式、数据库检索、文献对照方式进行鉴定。结果表明，有18个化合物对分类贡献比较显著，即潜在的生物标志物。这些物质均为溶血磷脂酰胆碱(Lyso-PC)类和脂肪酸类化合物，这说明脂质代谢（包括磷脂和脂肪酸代谢）紊乱很可能是造成脑缺血损伤后代谢异常的主要原因。　　 同时我们还通过反向药效团匹配方法，对丹参总酚酸成分与其作用通路进行模拟匹配，确定了潜在的药物靶标188个及作用通路28条。结合以上对药物基因、代谢不同水平上的药理研究结果，可以对丹参总酚酸中的有效化学物质成分进行初步确定。结果显示，药物中的14种成分均起到不同程度的药效作用，其中以丹酚酸B，丹参素作用通路最多，药效最佳。