本文对川西高原松茸主要产区九龙,丹巴,小金,雅江,理塘,稻城,乡城七个县的松茸资源生态环境进行了调查,并采集了32份松茸材料,应用RAPD,ITS RFLP和ITS序列分析等多种方法,对供试松茸样品的遗传特性进行了系统研究,结果如下。(1)川西高原松茸的突出特点包括分布地海拔高,松茸的生长海拔逐年升高;宿主多样,主要与黄背高山栎和川滇高山栎共生;出菇时间较早。(2) RAPD,ITS PCR-RFLP分析结果表明,在RAPD中,32个材料在GS=0.68时,被分为4个遗传群,各遗传群表现出一定的地域性;ITS rDNA PCR-RFLP聚类分析表明,在GS值为0.72的水平上供试材料可聚成7个遗传类群,绝大部分来自于相同或相似生态地理环境的材料聚成一类,即ITS-RFLP图谱类型与材料的生态地理环境具有一定的相关性;对各地理类群基于Nei氏无偏估计的遗传一致度的聚类分析表明,各地理类群间的遗传分化与其所处的地理生态环境具有较高的相关性。(3)根据RAPD,ITS PCR-RFLP结果,选取了8份松茸样品,进行了表型鉴定,并对其ITS片段进行了扩增、测序和系统发育分析。结果表明,经典的食用菌表型分类将8份材料归类为青冈口蘑和松口蘑两个种,但ITS序列系统发育结果表明,8份松茸样品ITS序列与已报道的NCBI号为AF367416、AF204806、AB368506等的Tricholoma matsutake序列在系统发育上高度同源,说明在分类上这些样品应属于同一个种。可见,经典的表型分类并不能反映菌株的系统发育地位,同时也说明,四川西南高原松茸菌间虽然存在一定的表型多样性和地理分化,但未达形成地理种的程度。