肝癌TACE前后lncRNA表达谱变化及lncRNA AC018682.1在肝癌进展的机制研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lynnshe
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目的:肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是最常见的肝原发性恶性肿瘤,在全球与癌症相关的死亡率中排名第三。尽管肝癌的诊断和治疗已大大改善,但由于肝癌早期通常没有症状或症状不典型,当出现临床症状时,肝癌大多已经进入到中晚期,因此每年肝癌导致100万人死亡。肝脏肿瘤的血供来源于肝动脉,肝动脉栓塞后导致肿瘤血供中断或减少,随后肿瘤发生坏死、缩小,达到治疗肝癌的效果,因此根据该原理经皮肝动脉造影及化疗栓塞术(Transcatheter hepatic arterial chemoembolization,TACE)越来越多应用临床并有效地延长肝癌患者的生存时间。目前,实体瘤反应评估标准(Response evaluation criteria in solid tumors,RECIST)是评估TACE疗效的主要方法,然而高碘油密度及扫描过程中容易产生碘油伪影,会降低增强CT识别肿瘤的能力,影响临床对残留或复发的肿瘤的判断。因此,寻找一个分子标志物对于评估TACE疗效非常重要。非编码RNA(Non-coding RNA,ncRNA)是一类能被基因组编码却不被翻译成蛋白质的转录本,最初ncRNA被认为是由基因转录产生的“噪音”。然而目前已经证明超过75%的基因组编码大量功能性ncRNA,并且是越来越多证据表明ncRNA在细胞生物学功能上起着重要的作用。根据转录本长度可将ncRNA分为两大类:小非编码RNA(Small non-coding RNA,sncRNA)以及长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)。SncRNA是〈200个核苷酸长度并且包括微RNA(Micro RNA,miRNA),小干扰RNA(Small interfering RNA),与PIWI相互作用RNA(Piwi-interactiing RNA,pi RNA)。LncRNA是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,最近已被证明可利用多种作用模式来调节基因表达。越来越多的证据表明,lncRNA在致癌和肿瘤抑制途径中均具有关键的作用。我们一直在寻找一个适合于临床评估TACE疗效更敏感的指标,在前期工作中,我们收集中国医科大学附属盛京医院介入科2018年-2019年5例患者行TACE治疗前后的血清,并通过高通量测序、生物信息学分析等实验,首次筛选并鉴定出lncRNA-AC018682.1可能是影响TACE疗效的关键因子。lncRNA-AC018682.1定位于人染色体2p21上,并含有2个外显子,但没有相关研究报道该基因的作用。因此我们将更进一步研究lncRNA-AC018682.1在肝癌进程中的作用,并探讨其相关机制。研究方法:1.收集中国医科大学附属盛京医院介入科2018年-2019年30例行TACE治疗前后的血清,通过q RT-PCR方法检测lncRNA-AC018682.1在血清中的表达情况。q RT-PCR检测肝癌细胞系及正常肝细胞内的表达水平,通过荧光原位杂交技术(Fluorescence in situ hybridization,FISH)实验确定lncRNA-AC018682.1在肝癌细胞系中的细胞定位。2.采用人肝癌细胞株Hep3B及HepG2体外培养,通过慢病毒介导的shRNA下调lncRNA-AC018682.1,q RT-PCR验证下调效率,通过CCK-8检测lncRNA-AC018682.1在肝癌细胞中增殖中的作用。通过Transwell实验检测lncRNA-AC018682.1在肝癌细胞迁移及侵袭中的作用。3.通过生物信息学预测能与lncRNA-AC018682.1竞争结合的miRNA以及其下游靶基因,通过双荧光素酶报告实验验证lncRNA-AC018682.1及miR-1226-5p之间相互作用,使用q RT-PCR验证下调lncRNA-AC018682.1后miR-1226-5p的表达水平。再次通过双荧光素酶报告实验验证miR-1226-5p及下游靶基因AURKA之间的相互作用。Western blot实验检测不同肝癌细胞系及正常肝细胞系中的蛋白表达水平。Western blot实验检测敲减lncRNA-AC018682.1后AURKA蛋白表达水平。在下调lncRNA-AC018682.1后的肝癌细胞中下调miR-1226-5p,通过CCK-8检测lncRNA-AC018682.1在肝癌细胞中增殖中的作用,通过Transwell实验检测lncRNA-AC018682.1在肝癌细胞迁移及侵袭中的作用,通过Western blot实验检测AURKA蛋白表达水平。4.为了探讨lncRNA-AC018682.1在细胞核内作用,通过双荧光素酶报告实验观察其与AURKA启动子之间关系,并用生物信息学分析得到能与AURKA启动子结合的转录因子KLF15,RNA结合蛋白免疫共沉淀(RNA binding protein immunoprecipitation,RIP)实验检测lncRNA-AC018682.1与KLF15之间关系。生物信息学预测AURKA启动子中与KLF15结合位点,并通过染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation assay,CHIP)分析KLF15在AURKA启动子上的富集水平。最后通过CHIP分析观察在敲减lncRNAAC018682.1后的肝癌细胞系中,AURKA启动子区域的KLF15富集水平。结果:1在TACE治疗前后lncRNA-AC018682.1表达存在明显差异,在肝癌细胞系中表达水平明显高于正常肝细胞系,并且在细胞核及细胞质内均有定位。2使用慢病毒介导的shRNA下调lncRNA-AC018682.1后能明显抑制肝癌细胞系的增殖、迁移及侵袭能力。3在细胞质内lncRNA-AC018682.1可以作为分子海绵吸附miR-1226-5p影响AURKA表达水平,进而影响肝癌细胞的增殖、迁移及侵袭能力。4在细胞核内lncRNA-AC018682.1通过募集转录因子KLF-15上调AURKA启动子活性影响其蛋白表达水平。结论:TACE治疗后lncRNA-AC018682.1表达存在明显差异,并且与肝癌细胞的恶性生物学行为密切相关。在细胞质内lncRNA-AC018682.1通过吸附miR-1226-5p影响AURKA表达水平,在细胞核内lncRNA-AC018682.1通过募集转录因子KLF-15上调AURKA启动子活性影响其蛋白表达水平,两者共同作用促进肝癌细胞增殖、迁移及侵袭。该研究为评估TACE疗效提供了一个新的分子靶标。
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