优化叶片叶绿素含量有利于提高冠层光合效率。第三期超级稻品种Y两优2号(YLY2)是由父本远恢2号(YH2)与母本Y58S杂交而成的两系杂交水稻,YLY2与其父本YH2叶片均具有低叶绿素含量的特性。为了鉴定控制YLY2叶绿素含量的关键基因,本研究以YH2和Y58S为亲本,采用单粒传的方式创建了含有276个株系的重组自交系(RIL)群体;利用基因组重测序方法构建了该群体的高密度遗传图谱,通过测定多年不同生长发育阶段叶片叶绿素含量的SPAD(叶绿素相对含量)值,开展了YLY2叶片叶绿素含量QTL(数量性状位点)的定位研究,为鉴定控制YLY2叶绿素含量的关键基因提供了参考依据。主要研究结果如下:(1)本研究鉴定出影响叶片叶绿素含量SPAD值的15个QTL,大多为负加性效应,其中9个与以往的研究位于相似位点,其余为新QTL位点,表明影响该RIL群体叶绿素的增效QTL主要来自母本Y58S。(2)2015-2018年,在第4号染色体分子标记Block46264和Block46306附近均检测到了影响叶绿素含量的负加性效应QTL,且贡献率达到了10%以上,为影响该RIL群体叶绿素含量的主效QTL。(3)2016-2018年,在第5号染色体分子标记Block51355附近也都检测到了影响叶绿素的负加性效应QTL,贡献率达到了5%以上,此区间对该RIL群体的叶绿素含量也具有一定影响。(4)不同年份和不同生育期定位到影响叶绿素含量的QTL不尽相同,这表明影响水稻叶绿素含量的遗传调控较为复杂,极易受到环境因素的影响。