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本文以尾叶桉和细叶桉两亲本及其杂交产生的124个子代为材料,运用EST-CAPS标记构建了桉树的遗传框架图谱。从GenBank共下载4037条桉树EST序列,拼接以后得到了3095条独立序列,并对2500条独立序列设计了PCR引物,在母本尾叶桉中能够成功扩增的有1684条。本研究利用6种限制性内切酶,对622条扩增产物长度大于400bp的EST进行了CAPS酶切多态性筛选,得到了能在作图群体中产生等位片段多态性的61个EST;同时,结合前期开发的12个EST-CAPS标记,共有73个标记进行了作图分析。研究结果如下:(1)对73个EST的酶切结果的χ2检验(α=0.05)表明,24个标记是偏分离的,偏分离比率为32.9%。由于标记数量较少,所以将所有的标记都用于作图分析。(2)分别用Mapmaker 3.0、JoinMap 4.0、FsLinkageMap 1.0三个软件进行了标记连锁分析。用Mapmaker 3.0在LOD为3.0的情况下,构建的图谱长度为537.3cM,有48个标记连锁成18个连锁群,连锁群内标记数为2-5个。用JoinMap 4.0在LOD不小于3的情况下,构建的图谱长度为654.0cM,有49个标记连锁成18个连锁群,连锁群内标记数为2-6个。用FsLinkageMap 1.0在LOD为3的条件下,构建的图谱长度为993.4cM,有63个标记连锁成17个连锁群,连锁群内标记数为2-10个。比较三个软件的分析结果,用Mapmaker 3.0构建的图谱与用JoinMap 4.0构建的图谱结果相近,有9个完全相同的连锁群。而用Mapmaker 3.0构建的连锁群与FsLinkageMap 1.0构建的连锁群相差较大,没有完全相同的连锁群发现。(3)根据Mapmaker 3.0构建的图谱总长537.3cM,初步估算对桉树基因组的覆盖度为33.9%-35.6%。