以国内大型基础设施项目为研究对象,综合运用供应链管理思想、激励理论、运筹学、计量经济学、博弈论及信息经济学等系统优化与决策建模方法,对工程项目供应链整合管理的基本架构进行了定性的理论框架分析。从激励协调角度,对项目集成化管理环境下基于供应链管理思想的工程项目协调决策问题进行了定量化的建模研究,通过求解分析获得了工程项目供应链成员之间的有效协调管理策略。对供应链的概念进行了扩展分析;结合国内外建筑行业环境、市场管理体制和大型基础设施工程项目管理模式的比较分析,提出了以项目公司作为构建工程项目供应链的核心主体的观点;构建了基于项目全寿命周期的工程项目供应链网链结构和工程项目供应链整合管理的基本要素架构;考虑不同实体关系层次及整合水平,基于供应链整合的战略阶段性特征和运作层次整合重组要素的递阶关系及螺旋式推进过程,构建了工程项目供应链联盟构建的基本过程及整合管理运作框架模型,分析了其基本运作思想和内在协调机制要素。考虑项目公司通过显性收益激励契约手段与单一标段承包商之间就工期目标优化问题进行协调决策。基于博弈论并应用二层规划方法建立了以项目公司为主方、承包商为从方的Stackelberg主从收益激励决策模型,采用逆向归纳法并设计了遗传算法求解该非线性规划问题的子博弈精练纳什均衡。结合算例对影响近似最优均衡解的相关因素进行了敏感性分析。研究表明收益激励可以实现项目工期控制目标协调优化和双方收益目标的帕累托改善。进一步应用激励理论及委托代理模型建立了项目公司与承包商之间的多目标(工期、质量)协调均衡改善的收益激励模型,应用一阶条件方法进行了求解。研究表明,通过提供均衡的激励组合策略可以使得承包商在多目标控制上提高并合理分配自己的努力水平或资源,实现多控制目标之间的协调均衡改善。模型算例分析也验证了模型的有效性。而且,对该问题进行了扩展研究,建立了一个两阶段动态收益激励模型。基于整个建筑行业市场环境,考虑到长效机制和隐性声誉激励因素,构建了一个隐性声誉激励机制与显性收益激励机制相结合的两阶段动态激励契约模型,分析得到声誉激励机制的有效均衡条件和实现帕累托改善的基本要求。结合具体算例对声誉激励效应的影响因素进行了分析。并将其推广到无限期的情形,分析了建筑市场环境下隐性声誉激励机制的存在及其对代理人的激励效应。