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目的应用甲基化特异性PCR检测甲状腺乳头状癌及癌旁组织中甲状腺功能基因NIS和抑癌基因RASSF1A基因启动子甲基化改变的特点并与患者的临床特征相关系，从功能基因和抑癌基因两方面探讨癌组织分子变化特征及失活机制。方法从甲状腺乳头状癌及癌旁组织中提取基因组DNA，采用甲基化特异性PCR方法分别检测NIS和RASSF1A基因启动子的甲基化状况。结果(1)功能基因NIS启动子甲基化状况：①30/34例甲状腺乳头状癌组织中检测到NIS基因启动子的甲基化，23/34例癌旁组织中检测到NIS基因启动子的甲基化，癌组织中NIS基因启动子甲基化显著高于癌旁组织(P＜0.05)。②有淋巴结转移的甲状腺乳头状癌组织(18/18例)NIS基因启动子的甲基化显著高子无淋巴结转移组(12/16例)(P＜0.05)。③临床Ⅰ期和Ⅱ-Ⅲ期的甲状腺乳头状癌病例中NIS基因启动子的甲基化无显著差异(P＞0.05)。(2)抑癌基因RASSF1A启动子甲基化状况：①甲状腺乳头状癌组织中RASSF1A基因启动子的甲基化的发生率为55.9％(19/34)，癌旁组织中RASSF1A基因启动子的甲基化的发生率为23.5％(8/34)，癌组织中RASSF1A基因启动子甲基化显著高于癌旁组织(P＜0.05)②有淋巴结转移的甲状腺乳头状癌组织RASSF1A基因启动子的甲基化77.8％(14/18例)显著高于无淋巴结转移组31.3％(5/16例)(P＜0.05)③临床Ⅱ-Ⅲ期甲状腺乳头状癌病例中RASSF1A基因启动子的甲基化的发生率为88.8％(8/9)明显高于临床Ⅰ期的44.0％(11/25)(P＜0.05)。(3)甲状腺乳头状癌组织中功能基因NIS和抑癌基因RASSF1A基因启动子甲基化的相关性分析：①在甲状腺乳头状癌组织中功能基因NIS启动子甲基化发生显著高于抑癌基因RASSF1A基因启动子的甲基化(P＜0.05)②功能基因NIS和抑癌基因RASSF1A的启动子的甲基化呈正相关(r_s=0.41，P=0.0158＜0.05)结论甲状腺乳头状癌组织中存在着抑癌基因RASSF1A基因和功能基因NIS基因启动子的异常甲基化，二者的基因甲基化提示呈一定的正相关性，可能相互影响共同参与了甲状腺乳头状癌发生发展过程。