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随着经济全球化和中国经济发展的深入,国际竞争愈演愈烈,企业要想在不断加剧的市场竞争和日新月异的环境中求得生存和发展,就必须紧紧把握科技创新能力的提升,而科技创新水平依赖于企业R&D投入绩效水平。R&D活动是企业科技创新的生命之源,企业只有不断地提高R&D水平才能使自身在国内和国际市场竞争中始终立于不败之地,这在商界、学术界和政界早已达成共识。通过对相关文献的研究发现,目前国内对创新绩效的研究,尤其是对R&D投入绩效评价研究大都集中在对国家、区域层面或一些比较发达地区的评价研究,或者对一些高新技术产业进行研究,而对于地理位置偏远、经济相对落后的新疆企业R&D投入绩效评价研究甚少。新疆正处于经济跨越式快速发展的阶段,提高企业的自主创新能力,提升企业R&D投入绩效水平对新疆的发展至关重要。本文从R&D投入绩效的相关文献研究入手,系统分析了R&D投入绩效评价的内涵及其特点,在综合国内外学者的研究成果的基础上,提出了R&D投入绩效评价的指标体系和方法体系;首先,从新疆工业企业的发展现状出发,依据2009-2013年间新疆工业企业的科技数据,运用描述统计方法,对新疆工业企业整体R&D投入产出现状及不同规模、不同性质和不同行业的R&D投入产出水平差异进行详细分析;然后,运用DEA模型对各行业的R&D投入绩效进行评价;接着,运用Pearson相关系数分析了新疆工业企业与企业经营绩效之间的相关关系;最后,基于前文的分析总结归纳了本文的研究结论,同时根据相关结论提出了相应的对策建议,主要结论如下:(1)新疆工业企业R&D经费占主营业务收入的比重(0.38%)低于全国平均水平(0.89%)0.51个百分点;且R&D人员主要为试验发展人员(90.94%),经费主要来源于企业资金(96.47%)。(2)新疆工业企业R&D投入特征体现在三方面:①与规模成正比,企业规模越大,R&D投入越多,大型工业企业的R&D投入占总数的2/3以上;②股份有限公司R&D投入占50%以上,其中R&D人员占新疆工业企业R&D人员总数的56.89%,R&D经费支出的占比为53.78%;③石油和天然气开采业R&D投入居首位,占比在1/4以上,石油和天然气开采业R&D人员占新疆工业企业R&D人员总数的29.09%,R&D经费支出占新疆工业企业R&D经费支出总额的28.86%。(3)新疆工业企业的22个行业中有50%为DEA有效,50%为DEA无效,其中DEA无效行业中有2各行业为轻度DEA无效,4个行业为中度DEA无效,5个行业属于严重DEA无效;(4)新疆工业企业R&D投入与企业经营绩效呈正相关,且具有滞后性;与企业规模的相关程度最高,均属于显著相关,而与成长能力的相关程度最低,属于低相关,且企业规模和盈利能力与R&D绝对投入量相关,而成长能力与R&D相对投入量即R&D人员占年末从业人员和经费占主营业务收入比重相关。