肺结核分子流行病学研究

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目的:本研究旨在寻找肺结核的遗传易感位点,探索宿主遗传因素差异对肺结核发病的影响,为肺结核的预防和药物研发提供理论依据。方法:1、对1218名汉族居民进行病例对照研究,其中病例组600例,对照组618例。进行流行病学调查和生化指标检查。用血液基因组DNA提取试剂盒提取DNA。运用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(restriction fragment length polymorphism–polymerasechain reaction,PCR-RFLP)技术检测CISH基因rs2239751和rs622502的基因多态性,探索CISH基因与中国汉族人群肺结核的关联性。2、验证肺结核GWAS中rs2057178和rs4331426在中国汉族人群中是否与肺结核相关。运用Pub med、Embase、中国生物医学文献、中国知网和万方数据库,系统检索2000年到2014年3月1日之间发表的研究rs2057178多态性或rs4331426多态性与肺结核关系的中英文文献,采用Stata version11.0软件进行Meta分析。结果:1、病例组平均年龄41.03±16.26岁;对照组平均年龄43.26±17.26岁。差异无统计学意义,P>0.05。病例组痰样本涂片阳性率为29.7%。胸片X线异常率为99.0%。卡介苗接种率31.2%。2、CISH基因的rs2239751和rs622502等位基因分布均符合Hardy-Weinberg(H-W)遗传平衡定律,表明抽样方法可靠,研究样本的群体代表性较好。3、rs4331426和rs2057178等位基因分布均符合Hardy-Weinberg(H-W)遗传平衡定律,表明抽样方法可靠,研究样本的群体代表性较好。4、CISH基因rs2239751位点多态性与肺结核相关性研究中,rs2239751位点基因型和等位基因分布在两组间差异有统计学意义,P值分别为0.02和0.01,并且携带C等位基因个体患肺结核的风险是携带A等位基因的个体1.16倍(OR95%CI=1.03-1.29,P=0.01)。5、CISH基因rs622502位点多态性与肺结核相关性研究中,rs622502位点基因型和等位基因分布在两组间差异均无统计学意义,P>0.05。6、验证肺结核GWAS中rs4331426位点在汉族人群中是否与肺结核相关研究中,rs4331426基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义,P>0.05。对基因分型结果按性别,年龄和涂片情况进行分层,仍然显示rs4331426基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义,P>0.05。7、验证肺结核GWAS中rs2057178位点在汉族人群中是否与肺结核相关研究中,rs2057178基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义,P>0.05。对基因分型结果按性别,年龄和涂片情况进行分层,仍然显示rs2057178基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义,P>0.05。8、rs4331426的Meta分析包括研究对象16325人,其中病例组6176人,对照组10149人。病例组和对照组中G等位基因的频率分别为36.8%和34.0%。非洲组的异质性检验无统计学意义,因此选用Peto Mantel-Haenszel method固定效应模型进行数据合并计算OR;亚洲组和总体的异质性差异有统计学意义,P<0.1,因此选用Dersimonian Lairdmethod随机效应模型进行数据合并计算OR值。Meta分析结果显示rs4331426在非洲人群中研究的合并OR值为1.18,95%CI为1.11-1.25;亚洲人群研究的合并OR值为0.85,95%CI为0.59-1.23;总体合并OR值为1.12,95%CI为1.02-1.23。显著性检验Z值为4.84,P﹤0.0001,差异具有统计学意义。漏斗图和Egger’s-test结果显示此次Meta分析存在发表偏倚的可能性较小。9、rs2057178的Meta分析包括研究对象23897人,其中病例组9421人,对照组14476人。病例组和对照组中T等位基因的频率分别为15.6%和18.2%。各研究间的异质性检验无统计学意义,因此选用Peto Mantel-Haenszel method固定效应模型计算合并OR值。Meta分析结果显示rs2057178合并OR值为1.21,95%CI为1.15-1.28。显著性检验Z值为6.90,P﹤0.0001,差异具有统计学意义。漏斗图和Egger’s-test结果显示此次Meta分析存在发表偏倚的可能性较小。结论:1、在汉族人群中rs2239751位点多态性可能是肺结核的危险因素之一。rs622502位点多态性可能与肺结核无关。2、在汉族人群中,经验证rs2057178和rs4331426位点多态性可能与肺结核无关。即使排除性别,年龄和涂片情况等混杂因素,rs2057178和rs4331426位点多态性可能与肺结核无关。3、rs4331426在非洲人群中可能是肺结核的易感位点,携带G等位基因比携带A等位基因患肺结核的风险高;在亚洲人群中rs4331426可能并非肺结核的易感位点。4、rs2057178在非洲人群中可能是肺结核的一个易感位点。携带T等位基因比携带C等位基因患肺结核的风险高。
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