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目的:揭示新疆部分地区不同来源Enterococcus faecium的耐药谱格局、耐药基因及毒力基因分布,为近年来我国畜牧养殖业中抗生素滥用引起的耐药基因扩散问题的科学评估提供理论参考依据。方法:采用3种培养基分离纯化肠球菌,使用种属特异性引物、rep-PCR和16S r RNA基因序列分析将分离到的肠球菌鉴定到相应种,挑出其中的E.faecium作为研究对象并对其进行抗生素耐药性、耐药基因和毒力基因的研究。结论:1、根据种属特引物PCR扩增结果,从121份原奶、161份手工奶酪、39份冷水鱼的胃肠道和30份母乳样品中分离得到1120株enterococci,其中含有571株E.durans、419株E.faecalis、127株E.faecium、3株E.hirae。127株E.faecium中70株来自手工奶酪;20株来自原奶;24株来自母乳;13株来自冷水鱼肠道。随后127株E.faecium通过Rep-PCR指纹图谱结果挑选了14株代表菌株进行16S r DNA序列分析,测序后16S r DNA序列经过比对后与其相似度达99%以上的均为E.faecium,可以确定这14株菌为E.faecium。2、原奶、母乳、手工奶酪和冷水鱼肠道分离的屎肠球菌的耐药谱有明显的区别。冷水鱼来源屎肠球菌对除利福平外的其他抗生素敏感,原奶、母乳、手工奶酪来源屎肠球菌对多种抗生素具耐药性。原奶屎肠球菌对包括诺氟沙星,左氧氟沙星,环丙沙星,四环素,红霉素,利奈唑胺和奎奴普丁/达福普汀在内的七种抗生素耐药。大部分母乳屎肠球菌对临床环境中常用的抗生素如氟喹诺酮,氨苄西林和青霉素耐药等耐药。然而,几乎每种类型的抗生素耐药菌株在手工奶酪屎肠球菌都都有检测到存在。此外,原奶、母乳和手工奶酪来源屎肠球菌分别检测到6、5和22种多重耐药谱,手工奶酪中的其中一种耐药谱含11种抗生素。尽管四环素、环丙沙星、氨苄青霉素、红霉素、万古霉素抗性基因在4中来源屎肠球菌中都有检测到存在,但在四环素、环丙沙星、红霉素、万古霉素耐药菌株中只检测到部分耐药基因:tet(M),tet(O),tet(K)and tet(L);gyr A,par C;erm B和van C2-C3。除Efa As外的其他毒力基因都在手工奶酪来源屎肠球菌检测到存在。