“农业稳则天下安”，农业是国民经济的基础，在中国经济发展中具有举足轻重的战略地位，是全面建成小康社会工作的重中之重。松桃县作为西部山区典型的发展不充分农业县，对其农业转型升级路径的研究不仅能促进松桃县经济发展，也能为同类型县域的农业转型升级提供经验借鉴。
　　本文从新结构经济学的视角，构建要素禀赋相似性测度指标，通过马氏距离对武陵山片区71个县、区进行初始禀赋相似性测算，筛选出与松桃县初始要素禀赋相似的县域，并通过面板实证分析确定要素禀赋升级与农业产业结构升级之间的关系。基于第三章的分析选取出贵州省沿河县、重庆市石柱县作为松桃县的比较对象，通过对近17年来的三个县要素禀赋结构变迁的动态分析，以及比较三个县从“十五规划”到“十三五规划”期间农业政策措施的不同，发现三个县的土地、劳动力和资本等资源禀赋都较为稀缺，交通和技术等资源禀赋较为丰裕；三县中石柱县的农业发展及转型升级成效最佳。通过分析不同时间段三个县的政府政策及要素禀赋情况，进一步分析总结了松桃县农业发展的瓶颈，主要包括五个方面：一是农业产业选择未遵循禀赋条件和比较优势，发展效果不佳；二是农产品附加值不高，产业化水平低，产业链短；三是农产品缺乏特色和品牌竞争力；四是市场开放程度不够，企业发展缺乏内生动力；五是农业和旅游业未能形成嵌套式发展。
　　最后，根据林毅夫教授提出的五类产业发展的战略理论，通过初始要素禀赋相似性测度和经济发展数据分析，最终确立了福建省尤溪县作为松桃县农业发展的追赶对象，并通过对尤溪县农业转型升级经验的总结和新结构经济学理论框架，分别从有为政府和有效市场两方面对松桃县农业转型升级路径提出对策建议。