水稻细菌性条斑病菌（简称水稻条斑病菌）（Xanthomonas oryzae pv.oryzicola）是稻黄单胞菌(Xanthomonas oryzae)种下的致病变种之一，从水稻的气孔和伤口侵入，产生水稻细菌性条斑病(Bacterial Leaf Streak，BLS)，是水稻上重要的细菌病害。同其他的革兰氏阴性植物病原细菌一样，水稻条斑病菌也含有保守的hrp(hypersensitive response and pathogenicity)基因簇，决定其在非寄主植物上的过敏反应(hypersensitive response，HR)和在感病寄主上的致病性(pathogenicity)。细菌与水稻互作时，通过由hrp基因簇编码组装形成Ⅲ型泌出系统(TypeⅢ Secretion System，T3SS)，将各类效应蛋白注入植物细胞中从而导致植物产生抗（感）病性。　　 水稻条斑病菌的hrp基因簇包含27个基因，除由调节因子HrpG和HrpX进行调控外，新发现的HrpD6蛋白也参与调控过程，它对hpa2、hpal、hrcC、hrcT和hpaB具有调控作用。有关HrpD6如何与HrpX协同性或独立性地调控上述基因，机理尚不清楚。　　 上述五个基因中，hpaB基因所在的hrpD操纵单元除hpaB外，其他基因均不受HrpD6调控，推测hpaB还存在另外的启动子。为了明确hpaB基因的启动子，本研究以水稻条斑病菌野生型菌株RS105为出发菌株，通过功能互补hpaB基因突变菌株R△hpaB，发现hpaB基因除了其所在的hrpD操纵单元的启动子(DoB)，毗邻hpaB基因上游的一段区域(upB)也具有启动子活性，参与hpaB基因毒性功能的发挥，暗示可能upB启动子可能参与HrpD6对hpaB的调控。　　 为了研究HrpD6对上述基因的调控是否通过直接的蛋白与DNA结合的方式实验，我们用酵母单杂交进行初筛，结果显示HrpD6对hpal和hpa2基因的启动子具有结合活性，但不能结合hpaB基因的启动子，进一步的凝胶滞阻实验证实HrpD6能结合hpal和hpa2基因的启动子中的PIP-box序列。这说明HrpD6对hpal和hpa2的调控是一种直接的作用，而对hpaB则是一种间接的调控。　　 既然HrpD6与HrpX存在相似的调控特征，为了查明两者的关系，进行了酵母双杂交，结果表明HrpD6与HrpX并不存在互作关系，随后的EMSA揭示二者存在竞争关系。为了检测HrpD6与HrpX对基因的调控过程是否完全相同，选择hpal基因的PIP-box，截短后进行EMSA，结果发现HrpD6可结合PIP-box两侧TTCGC基序及其Nx序列，而HrpX不能结合Nx;分析Nx序列发现受HrpD6调控的基因中多存在类似TTCGC或其互补序列AAGCG，据此规律我们对已报道的受HrpX调节的基因的Nx进行分析，然后通过RT-PCR检测，最终获得两个Nx中含有类似TTCGC(AAGCG)的基因受HrpD6调控。以上研究结果为进一步揭示稻黄单胞菌致病机理和调控网络，及进一步发掘HrpD6调控因子提供线索。　　 水稻条斑病菌的HrpX能够调节hrp基因的表达，而在被调节的因子启动子区域一般含有PIP-box。因此PIP-box可以作为一个有效的筛选标记从大量的基因组数据中获得HrpX调节子。基因组信息提示，水稻条斑病菌的很多基因在启动子区域都含有完整或不完整的PIP-box。因此为了从水稻条斑病菌中获得更多受HrpX调节的基因，本研究选取5个候选因子(hrpB1、avrBs2、ecpA、kgtP和Z1234)借助启动子-gfp融合表达方法，导入水稻条斑病菌hrpX基因突变体中，与水稻悬浮细胞互作后观察荧光有无或强弱，建立了筛选HrpX调节子的体系，同时也提示某些含有不完整PIP-box的因子如kgtP和Z1234也是HrpX调节子，这为新的Ⅲ型效应分子的发掘提供依据。