由于社会的发展,科学技术的不断更新,竞争日趋激烈,归根到底,就是科学技术和高素质人才的竞争。因而,高等教育与社会的联系愈加紧密,教育功能更加丰富,高校的体制改革受到各个国家的关注。国家、社会对高校的影响越来越大,高校内部的组织机构更加复杂,形成了多种力量共同治理学校的权力结构。高校内部管理体制的主要表现在各利益主体之间权力的分配和他们之间的相互作用,即高校的内部治理结构。虽然高校内部权力表现是多样的,但是学术权力和行政权力是高校内部治理结构的核心。学术权力和行政权力有各自存在的合理性。高等学校作为教育教学和科学研究的学术性社会组织,学术权力是其最基本的权力。由于高校与社会的联系愈加紧密,高校内部组织机构日益复杂,学术权力是无法保证高校功能的体现和高校的运转,因此,高校的行政权力是现实的强烈需求,行政权力一方面,加强了学校与社会,学校与学校之间的联系,另一方面,行政权力保证学校内部有序、高效的运行。虽然学术权力和行政权力有着本质的区别,但是两者权力在高校内部管理中缺一不可,只有两者权力共同作用于高校的治理,才能保证高等学校目标的实现和社会功能的体现。世界主要国家的高等学校,由于学术权力和行政权力的不同地位,治理结构也存在很大的差异。但是其存在很多共性：西方高校内部以学术权力和行政权力的二元权力结构为基础；西方高校都以学术权力为主导,崇尚学术自由；学术权力和行政权力的作用权限较明确；都实行委员会制的决策模式。这对我国高校的治理结构有很大的启示：从高校的运行机制上来看,要求我国高校内部应该学术权力和行政权力并存；从高校内部权力结构来看,需要提高学术权力的地位；结合我国现代社会经济发展的实际情况和我国高等教育的现状,采取科学有效的方法,合理解决学术权力和行政权力现存的矛盾。从新中国成立后,我国高校的内部管理体制经过多次变革,但是国家对高校的集中统一管理并未改变,因此,我国高校的内部管理体制对政治体制和社会经济体制依赖性很强。另外,受到我国传统文化的影响,使我国高校内部学术权力和行政权力的矛盾日益突出。例如,行政权力泛化；行政权力和学术权力权限不清；学术组织机构不健全等矛盾。这些冲突导致了一些学者不能专注于教育科研,而是追逐行政职位和行政权力,助长了“官本位”思想的蔓延,因此,在高校中一人承担双重身份的现象非常普遍。为了解决我国高校内部治理结构中学术权力和行政权力的均衡问题,结合我国高校的实际情况,应该从文化和制度两方面得到改善：转变观念,培养高校学术氛围；提升学术影响力,强化学术权力；横向实行学术事务和行政事务决策制约体制;纵向扩大院系权力,权力中心下移。