分子生物学技术的发展,使得从上世纪80年代初诞生的古代DNA研究逐步走上科学的发展轨道,并结合分子人类学、体质人类学、考古学、语言学、民族学等多种学科,为解决诸多科学问题,比如灭绝物种的进化谱系定位、早期智人和晚期智人的共存关系、动植物的驯化等等,提供了极有价值的信息。中国的考古文化遗址众多,其中的古代人类遗骸不仅为人类学研究提供了物质基础,也为古代DNA研究提供了弥足珍贵的财富,使得我们可以通过现代分子生物学技术了解早期先民的渊源、遗传结构以及和现代人群的关系,从而为揭示晚期智人在中国的进化和迁徙历史提供重要线索。按照学术界公认的古代DNA研究可靠性标准,我们对来自两个不同时期和不同地域的考古遗址——距今约2200年的秦始皇陵修陵人墓地和距今约2100年的新疆且末加瓦艾日克墓地——的人类遗骸进行了科学、严谨的古代DNA分析,获得了可靠的古代DNA数据。前者的研究结果显示,秦始皇陵修陵的劳工来自中国各地,不仅有汉族而且有少数民族,并且地域来源不局限于中国北方;后者的研究结果显示,在2500年前,新疆地区就已经存在欧亚大陆东、西方人群的基因融合,并且其中的西部成分主要来自西伯利亚而不是中亚。此外,我们从技术层面上对古代DNA的抽提进行了研究,发现抽提阴性并不能如预期地检测到痕量的污染,并提出了相应的改进方法,推进了古代DNA研究的可靠性。