在建工程抵押制度是将正在建设过程中的建筑物进行抵押，和我们传统的对于抵押物的规定是不同的，这样能够使在建工程的价值得到最大的发挥，帮助开发商获取更多的资金进行建设，发挥了物的使用价值，有利于房地产市场的快速发展和繁荣。所以我国的相关法律才会对其效力予以承认以及在实践中得到运用。但是基于在建工程抵押具有一些特殊之处所以会很容易和其它的抵押权发生冲突，进而引发许多问题。因此文章将会对在建工程抵押制度进行理论层面的分析，对于其和其它的抵押权发生冲突的原因进行分析从而找到解决方法以解决这些冲突。　　本文在结构上分为五个部分：第一部分主要是对在建工程抵押进行概述，将对在建工程的概念、法律特征,以及在建工程抵押的法理基础进行详细的介绍。将在建工程抵押和物权法上传统的抵押进行比较从而得出其存在的合理性。第二部分是对在建工程的相关法律规定进行一些介绍。在该部分主要是对国内外的关于在建工程的规定进行介绍，根据不同的国家所采纳的不同的立法例分为一体主义和分离主义，本文将对这两种立法例进行详细的介绍。然后将这两种制度进行比较以此来发现一些可供我国借鉴的地方。第三部分是关于在建工程抵押权的设定的问题，该部分主要从三个方面来进行分析。第一，主要是就在建工程在设定抵押时应该符合哪些条件主要讨论了在建工程抵押权设定时应满足的条件，包括一些普通抵押所需满足的以及它所特有的那些条件；第二，将对在建工程抵押登记的性质所存在的争议进行分析，以及其在工程结束后转换为一般登记时所需要重视的问题，提出所认可的观点并对其合理性进行分析；第三，确定在建工程抵押所能够担保的债权额度到底是多少，这些需要通过对在建工程进行价值评估以及考虑抵押双方当事人的意思自治来确定。第四部分主要就在建工程抵押所存在的权利冲突进行分析，这些冲突主要包括在建工程与建设用地使用权抵押的冲突、在建工程抵押与商品房预售抵押的冲突、在建工程抵押与工程款优先受偿权的冲突以及在建工程抵押与商品房买卖预告登记的冲突，接着对这些冲突产生的原因进行分析，搞清其缘由。第五部分则是对于以上这些冲突类型进行进一步研究，分析其利益冲突的平衡规则，结合当前的一些做法提出一些解决的意见，以此来促进这一问题的解决。