随着全球经济的日渐复苏和国际贸易保护主义的重新抬头,进出口企业在对外经济贸易活动中,尤其在产品研发、制造、销售等环节面临的质量、技术、卫生、环保标准等风险因素大大增多,日益快速发展的进出口外贸形势对现行的检验检疫监管工作提出了更高要求,“非典”、禽流感、H7N9疫情的爆发也对检验检疫应对公共卫生突发事件的处置、疫情疫病预防性控制预警提出了严峻的考验。边民互市贸易作为边境贸易的重要组成部分,无疑也是对外经贸领域中一种不可或缺的存在形式。对于边民互市特殊的检验检疫监管模式也经历着从无到有、从不科学不统一到不断完善创新日渐规范严谨的历史变迁。如何更进一步地弥补现有监管体制漏洞、创新一整套更完备的监管模式和科学全面地进行机构职能改革是今后一段时间内检验检疫系统所要紧紧围绕的中心和工作重点。本文以现行边民互市贸易检验检疫监管形势为出发点,分析当前形势下我国检验检疫监管模式存在的问题和困难,着重提出未来改革创新方向和具体应对措施,将一系列前沿的观念和思想融入未来的检验检疫监管体制,最终形成一整套完整的边民互市贸易检验检疫监管模式作为该文的最终研究成果,以检验检疫机构职能改革风帆下的一叶扁舟为检验检疫系统助航。