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硝化作用即氨氮经亚硝酸盐再氧化为硝酸盐的过程,长期以来一直认为分别由氨氧化微生物和亚硝酸盐氧化微生物共同催化完成。但能够独自完成两步硝化过程的微生物——全程氨氧化微生物(comammox)的发现从根本上颠覆了我们对全球氮循环的传统观念认识。我们迫切需要对它们在生态系统中的分布以及在氨氧化过程中发挥的重要性进行研究和评估。在本研究中我们成功设计出专门针对comammox amoA基因(comamoA)的引物对,首次利用该引物对污水处理系统中comammox的丰度、活性以及群落多样性进行研究,并与传统的氨氧化细菌(AOB)和氨氧化古菌(AOA)进行比较。实时荧光定量PCR(qPCR)结果显示,在14个活性污泥样品中comamoA基因的丰度为2.38X107至3.25×109 copies/g干重污泥,甚至超过污水处理系统中一直被认为的主导者——氨氧化细菌的135倍。此外,通过逆转录qPCR实验检测出comamoA基因在8个活性污泥样品中活性丰度为1.5X 105至3.0× 109 copies/g干重污泥,表明comammox在氨氧化过程中可能发挥重要作用。系统发育分析显示comamoA基因序列形成了不同于传统AOB amoA基因序列的独立分支,Nitrospira nitrosa和Nitrospira nitrificans菌群不仅在污水处理系统中大量存在且发挥活性。本研究污水处理厂中针对AOA和AOB的系统发育分析揭示了Nitrosospaera sister和Nitrosospaera菌属是优势AOA菌群且参与表达活性,AOB中广泛存在且发挥重要氨氧化作用的菌属是Nitrosomonas。研究结果表明了 comammox细菌可能在污水处理系统中丰度较高且在氨氧化过程中积极发挥活性,为今后针对comammox的生态学特征研究提供了重要的见解和坚实基础。