论文部分内容阅读
目的：本研究选取云南西南边境三个少数民族孤立村落民族，1）通过HBV抗原抗体检测，明确该地HBV感染状况;2）通过直接测序明确流行的HBV基因型;3）通过系统进化、系统地理进化及贝叶斯分析，估算特定基因型进化动力学及起源，4)探索该地流行的HBV基因异质性。 方法：收集傣族、哈尼族及瑶族共909份血清样本，采用酶联免疫吸附法检测乙型肝炎病毒的表面抗原(HBsAg)、表面抗体(HBsAb)、e抗原(HBeAg)、e抗体(HBeAb)及核心抗体(HBcAb)。使用DNAStar、BioEdit、Clustal X、MEGA5、BEAST、FigTree等软件对特定基因型进行种系进化、地理进化、动力学分析及基因异质性分析。使用SPSS软件进行统计处理。 结果：1）.该地三个少数民族HBsAg阳性携带率为17.1％，20-40岁组人群HBsAg携带率显著高于20岁以下及60岁以上人群（21.5％ vs11.9％ vs7.3％，x2=5.935，P=0.015;x2=8.755，P=0.003）。HBsAg、HBeAg、HBeAb及HBcAb阳性率在不同民族间有差异，其中傣族及瑶族阳性率显著高于哈尼族(P＜0.05)。30-50岁组傣族及瑶族HBsAg(+)显著高于哈尼族，傣族及瑶族间无统计学差异。2).153条HBV S基因序列扩增阳性，依据S基因序列信息进行分析，这一地区流行的基因型为C、B及I三种类型;流行的血清型为adrq+，adw2，ayw2及adw3四种类型。3).HBV/I基因型S序列在严格分子钟模式下，核酸替代率为3.74×10-4位点/年，松弛分子钟模式下，核酸替代率为6.93×10-4位点/年;HBV/I基因型在严格分子钟模式下，最近共同祖先起源于70年前;松弛分子钟模式下，最近共同祖先起源于30年前。贝叶斯天空曲线分析显示，20世纪80年代，HBV/I基因型在亚洲有过快速传播流行。地理进化树及核酸序列特异性分析显示，中国、越南及部分老挝株为HBV/I1基因亚型，大部分老挝及印度株为HBV/I2基因亚型。4）.该地主要流行B2及B3亚型，瑶族样本S基因存在特异性核酸分布(nt13A，nt344A，nt379A，nt397T，nt659G，nt666C，nt671C);5).该地主要流行C1及C2基因亚型，C基因型仅有16种S基因序列;6).C1基因亚型与C2基因亚型S基因序列存在8个特异核苷酸差异分布(ntC12A，T158C，T213C，C246A，T438C，T465C，A629G，A680G)，其中，A680G显示为HBsAg终止码偏嗜性。 结论：1）该地人群HBsAg(+)携带率高于全国平均水平，应加强对这一地区HBV感染的监控。2）HBV进化动力学研究时应整合时空等多因素进行计算。3）S基因序列具有亚型特异性。4）应当建立新的HBV亚型分类标准。