我国正处于经济转型时期，国内企业面临着激烈的竞争环境，企业一方面通过产业整合来扩大企业规模，另一方面需要通过加强对人力资源的投入提高企业的运营效率，提高企业的市场竞争力。这种背景下，企业并购与解雇的并行是中国企业成长的必经阶段。企业并购中不仅劳动关系处于不稳定的状态，企业的解雇行为更是侵害到到劳动者的诸多权益。劳动合同法虽然专门规定了劳动合同继承制度，但仍存在很多不合理与不完善的地方，虽然对解雇的条件做出了细致的规定，但仍然存在着法律理论和实践上的矛盾。我国现行立法和法学理论研究对于企业并购的关注点，偏重于并购方与被并购方的权利义务的研究，对资产问题、股东权益问题等关注较多，而往往忽略了企业并购中的劳动者权益保护问题。本文通过分析企业并购中具体的劳动者权益，探究在企业并购中保护劳动者权益的理论基础，并重点分析与企业并购中劳动者权益密切相关的劳动合同继承和解雇保护制度，尝试提出一些改进方案。