人工合成甘蓝型黄籽油菜no.2127-17种皮颜色遗传基础研究

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油菜是世界上四大油料作物之一,也是我国最重要的油料作物,在国民经济和人民生活中占据重要地位。油菜的主要利用途径是用其种子榨油及榨油后的菜饼作动物饲料。所以,提高油菜种子的含油量和蛋白质含量是提高油菜利用价值的重要途径之一。大量研究表明在相同遗传背景下,黄籽油菜的含油量和蛋白质含量高于黑籽且黄籽油菜具有种皮薄、纤维素含量低、色素少、油清澈透明、单宁和鞣酸等多酚化合物含量低等一系列优点。因此选育优质高产的黄籽油菜成为当前油菜育种的重要目标之一,黄籽的遗传基础和分子机理的研究也成为油菜研究领域中的热点课题之一。本研究以人工合成的黄籽甘蓝型油菜no.2127-17为研究对象,通过两种方法:经典的遗传学分析方法和QTL定位分析法分别对no.2127-17的种皮颜色遗传基础进行研究。研究结果如下:1.黄籽亲本no.2127-17分别与9个来源不同的黑籽材料配制杂交组合,研究了9个组合的37个分离世代的种皮颜色,发现:在no.2127-17×SW0780,no.2127-17×94560和no.2127-17×94545杂交组合中,黄籽对黑籽为部分显性,亲本间存在两对基因的差异(Y和B),在no.2127-17×1141B杂交组合中,黄籽为部分显性,亲本间表现出三对基因的差异(Y,B和C),其中Y对B和C具有显性上位作用;在杂交组合no.2127-17×ZS no.10中,黄籽为隐性,亲本间存在两对基因的差异(D和Y),在no.2127-17×HS no.3,no.2127-17×XY no.15,no.2127-17×94570和no.2127-17×HS no.4这四个杂交组合中,黄籽为隐性,亲本间表现出三对基因的差异(D,Y和B/C),其中D对Y具有显性上位性。结果表明:甘蓝型黄籽油菜no.2127-17的种皮颜色至少由4对主基因控制:部分显性黄籽基因Y,黑籽基因B、C和D,其中黑籽基因D对Y基因为显性上位,Y基因对黑籽基因B和C为显性上位。2.构建了Quantum/no.2127-17 DH群体的遗传连锁图谱,包括207个SSR标记,190个SRAP标记,分为19个连锁群,总长1747.4cM,标记间平均长度为4.4cM。构建了no.2127-17/94570 F2群体的遗传连锁图谱,包括94个SSR标记,179个SRAP标记,分为19个连锁群,总长1055.4cM,标记间平均长度为4.2cM。采用共同的SSR标记,将本图谱与甘蓝型油菜通用图谱进行了初步对应。3.应用复合区间作图法对Quantum/no.2127-17 DH群体和no.2127-17/94570 F2群体群体进行种皮颜色QTL定位。在Quantum/no.2127-17 DH群体中,三年均检测到一个主效QTL(命名为qBnsc-18a),位于N18连锁群上,不同年份解释的表型变化在47.16%-60.92%之间。两年均能检测到的QTL有2个,分别分别于N5和N3连锁群上,解释的表型贡献率低于5%。在no.2127-17/94570 F2群体中,两年均检测到3个种皮颜色QTL,其中位于N9连锁群上的QTL(命名为qBnsc-9a)对种皮颜色具有最大的表型贡献率,可解释50%以上的表型变异。位于N18连锁群上CB10504A-CB10092区间的QTL可解释9.03-11.72%的表型变异,该QTL与Quantum/no.2127-17 DH群体中检测到的主效QTL (qBnsc-18a)位于相同的区间。另外在N8连锁群上检测到一个微效QTL。4.在no.2127-17/94570/no.2127-17 BC1群体中,利用集团分析法(BSA)与AFLP技术相结合筛选与种皮颜色基因SC连锁的分子标记,共获得20个与种皮颜色基因连锁较紧密的AFLP标记。任意选取其中的5个AFLP标记(EA7MG8210, EA8MG5170, EA5MC4240, EA9MC4110和EA10MC9220)定位到no.2127-17/94570 F2群体的遗传连锁图谱上,发现5个标记被定位在N9连锁群CB10373B-CB10504B之间,为主效QTL (qBnsc-9a)所在的区域,表明SC基因与qBnsc-9a是相同的种皮颜色基因位点。5.根据主效QTL(qBnsc-18a)区间分子标记的生物信息学及甘蓝型油菜遗传连锁图谱与拟南芥染色体比对的信息,开发IP标记和SSR标记,对主效QTL区间进行加密。将开发的标记分别定位到Quantum/no.2127-17 DH群体和no.2127-17/94570F2群体的连锁图谱上,结果发现:qBnsc-18a区段内增加了6个IP标记和3个SSR标记,qBnsc-9a的区段内增加了1个IP和3个SSR标记,成功的将QTL(qBnsc-18a)区段缩短至6.6 cM,将QTL (qBnsc-9a)区段缩短至5.7 cM。6.根据no.2127-17/94570 F2群体初步定位的结果,构建了以no.2127-17为轮回亲本,94570为供体亲本的主效QTL (qBnsc-9a)的近等基因系。使用白菜型黑籽油菜3H129和黄籽沙逊两个亲本,以黄籽沙逊为轮回亲本(母本),以3H129为供体亲本,采用连续回交和表型选择的方法,目的是构建白菜型油菜中与qBnsc-9a相同的基因的近等基因系。
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