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猫疱疹病毒Ⅰ型（Feline herpesvirus 1,FHV-1）属于疱疹病毒科（Herpesviridae）甲型疱疹病毒亚科（Alphaherpesvirinae）水痘病毒属（Varicellovirus）,是猫病毒性上呼吸道疾病的主要病原体,临床上多与猫杯状病毒混合感染。通常幼猫多发,成年猫在高拥挤环境下也可能成为易感动物和传播源。FHV-1感染初期,患猫的主要临床症状为精神沉郁、浆液性流涕和结膜炎,对于FHV-1的感染及其继发的疾病目前未能发现有效的预防和诊疗手段。1957年北美学者从幼猫体内分离到首株FHV-1,随之欧洲及亚洲部分国家相继有学者报道FHV-1的分离情况和流行病学调查。但由于FHV-1没有特定的流行特征,因此对其流行病学进行分析困难重重。我国分离到FHV-1的时间较晚,但对FHV-1的研究也取得了一定的进展。从研究其临床诊疗方法逐渐发展到研究其分子生物学特性。本研究通过采集样品、对FHV-1的分离鉴定与纯化以及以二代测序技术为主的基因测序技术对一株FHV-1分离株全基因组的保守性和多样性进行研究。本研究主要从以下四个方面进行:一是从广州地区宠物医院共采集112份眼鼻拭子样品,采集时记录采集对象的年龄、性别、绝育去势情况和临床症状。拭子样品经预处理后接种猫肾细胞（Crandel feline kidney cells,CRFK）进行分离和培养。对出现细胞病变（Cytopathic effect,CPE）的对应样品进行特异性PCR鉴定和一代测序。分离和鉴定结果显示本次采集的样品中有7个阳性样品。对样品信息进行统计并将猫的年龄和性别信息与样品进行相关性分析,分析表明猫的年龄和性别不能作为FHV-1感染的流行特征。二是对各阳性样品的胸苷激酶（Thymidine kinase,TK）基因进行核苷酸同源性分析,其核苷酸同源性高达100%。对各阳性样品进行进一步鉴定,其中一个阳性样品的电泳结果显示这个样品中可能有其他病毒污染或混合感染,但一代测序结果表明这个样品没有外源病毒。选取这个阳性样品作为FHV-1分离株进行纯化,纯化传代至F5,再经PCR鉴定,其结果表明FHV-1分离株经5代纯化后,其纯净性良好。三是以NCBI上的FHV-1全基因组（GenBank登录号为NC013590.2）作为参考序列,对FHV-1分离株进行二代测序并分析其全基因序列的有效数据概况、组装概况和单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）。之后将FHV-1分离株的全基因序列与参考序列进行比对。有效数据概况和组装概况表明本研究二代测序结果具有可靠性,相对于参考序列,FHV-1分离株全基因序列中共有20个SNP。其中一个非同义编码区SNP位于gG基因,目前未知其对gG基因的功能和影响,其它SNP位于未鉴定的蛋白中。本研究中FHV-1分离株的SNP数量在其全基因组碱基数量中所占的比例不足0.1%。同时,在二代测序所得的FHV-1分离株全基因序列中发现一段未知序列,但这个未知片段经一代测序测得其序列,表明FHV-1分离株的全基因组中没有序列缺失。四是经一代测序测得FHV-1分离株的主要毒力基因,并对FHV-1分离株的全基因序列和主要毒力基因进行系统发育分析。结果显示FHV-1分离株与FHV-1历史分离株的进化关系近,核苷酸同源性高,全基因组高度保守;保守区域的毒力基因与FHV-1历史分离株的核苷酸同源性也较高,抗原蛋白和跨膜蛋白则与FHV-1历史分离株的对应基因核苷酸同源性低。以上结果表明对FHV-1的研究需要结合全基因序列以及主要毒力基因进行系统发育分析。本研究得出的结论是:2016年2017年广州地区一株FHV-1分离株的基因组保守性高;改变传统的流行病学调查方法,对FHV-1进行分子流行病学调查更为可行;对FHV-1的主要毒力基因进行更为深入研究可能有利于克服FHV-1的防治难题。本研究通过对FHV-1的分离、鉴定及纯化,首次于国内运用基因测序技术对广州地区一株FHV-1分离株的全基因组进行分析,丰富了国内FHV-1的研究内容,有利于临床工作者对FHV-1的深入了解。