人类基因组组蛋白修饰与基因表达的相关性

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基因表达受各种综合因素的调控,它是一个高度复杂的过程.在生物的发育和生长过程中,基因在拥有相同DNA序列的状态下,表达水平却完全不同.生物的遗传信息不是仅由DNA决定的,而是与同样承载着遗传物质的表观遗传共同决定的.表观遗传是基因表达调控机制中的重要内容,针对组蛋白修饰这种主要的表观遗传调控方式已经开展了大量的研究工作.基于组蛋白修饰对基因表达的调控作用,本文研究了人类H1细胞系的基因表达水平与组蛋白修饰的关系.  首先,我们分析了26种组蛋白修饰在人类全基因组中高表达基因和低表达基因的启动子,外显子和内含子区域的分布特性。结果发现,在高表达和低表达基因的这三个功能区域,组蛋白修饰水平存在差异.H3K27me3在高表达基因的启动子,外显子和内含子三个功能区域的修饰丰度明显都要比低表达基因丰度低,然而,H3k4me2和H3k4me3在高表达基因的各功能区域含量都明显高于低表达基因.同时,我们发现特定的组蛋白修饰在两类基因的三个功能区域的含量分布不一致.所有的乙酰化修饰在高表达基因的三个功能区域含量分布中,启动子含量最高,然而在低表达基因中却表现为外显子含量最高.  其次,我们分析了26种组蛋白修饰在人类第四条染色体的高表达和低表达基因的启动子,外显子,和内含子区域的分布特性。我们把基因启动子分为20个窗口,外显子10个窗口,内含子10个窗口.研究发现,各组蛋白修饰在高表达基因的启动子,外显子和内含子三个功能区域的含量与低表达基因各功能区域的含量存在差异.同时,我们也发现特定的组蛋白修饰在两类基因的三个功能区域的含量分布不一致.  本文的研究结果,不仅证实了组蛋白修饰和基因的表达调控有关,而且这种调控作用具有区域特异性。同时,也证实了组蛋白修饰在高表达基因的含量分布与低表达基因分布不一致.
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