伴随我国产业结构的不断升级,研究生教育在我国高等教育层次中的地位越来越凸显。研究型大学的研究生教育,承担着重大的历史使命和责任。我国研究型大学的研究生教育主要是以研究生院制度为载体的。明确研究生院制度的本质,探讨研究生院制度赖以运行的研究生教育组织结构,对于推进我国研究型大学的研究生教育的发展具有深远的意义。研究生院制度实质是专业式的研究生教育模式。这种模式的实现方式多种多样,这种模式赖以发挥作用的研究生教育组织结构亦各不相同。本文以我国研究型大学的研究生院制度为研究对象,以研究生教育组织结构为切入点。首先,追溯了我国研究生院制度的起源,梳理了研究生院制度的发展历程,并总结了我国研究生院制度确立以及发展过程中显示出来的特点。而后探讨了美、日两大发达国家研究生院制度赖以实现的组织结构状况及其特点。并且系统的分析了我国研究型大学研究生院制度赖以运行的组织结构存在的问题及其原因。在此基础上从组织结构的视角提出了我国研究型大学的研究生院制度应该实现的目标以及目标实现的策略。本研究力图构建一个符合研究型大学研究生教育发展的组织结构。在这个组织结构中,研究生教育成为研究型大学的主体部分、研究生教育系统内部能够实现相对合理的权力配置、研究生教育组织结构能够很好的兼顾不同的研究生教育目标。构建这样一个完整的研究生教育组织结构,要靠政府和高校的共同努力来实现。政府应该继续实行宏观调控,但是必须要转变管理方式,给予研究型大学较大的自主权。对于高校而言,必须要积极调整研究生教育组织结构,重组研究生教育资源,从而不断的提高资源利用的效能和研究生教育的质量。