基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立及低叶酸刺激Shh/SPP1信号轴促进宫颈癌细胞增殖和侵袭作用

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:renxin216
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目的:
  1.分析影响CIN1患者进展的危险因素,并建立预测模型;
  2.利用综合生物信息学分析,筛选与宫颈癌患者预后相关的基因,构建宫颈癌患者预后模型,为之后的基础实验提供参考;
  3.通过细胞实验,结合生物信息学,验证叶酸在宫颈癌作用中的分子机制,为之后的临床治疗提供理论基础。
  方法:
  1.通过对课题组一项队列研究进行分析,利用临床流行病学分析影响CIN1进展的危险因素,使用Nomogram构建预后评分表;
  2.基于GEO、TCGA、GTEx数据库,对宫颈癌进行综合生物信息学分析,构建了一个宫颈癌患者预后模型;
  3.利用PPI网络,预测与叶酸、Shh相关的基因,并使用细胞增殖、划痕、侵袭检测叶酸对siha肿瘤细胞的生物学行为的影响;
  4.采用Westernblot分析叶酸对Shh及下游基因SPP1蛋白水平的影响,并低叶酸的拮抗剂(5-氮杂胞苷),进行进一步验证。
  结果:
  1.HPV、FRα、P16、血清叶酸可作为一个CIN1疾病进展临床预测模型,较单独HPV预测价值更大,并结合Nomogram评分表,可定量估计CIN1患者预后;
  2.构建影响宫颈癌发生的中枢基因,如KIF20A、DLGAP5、CDC20、CDK1、KIF11、CCNA2、KIF2C、TOP2A、BUB1B和CCNB2。利用ESTIMATE发现宫颈癌患者中,免疫细胞主要影响宫颈癌患者的生存时间,基质细胞影响较小。宫颈癌预后多基因模型,受试者曲线下面积0.927,其危险系数影响患者生存时间,结合年龄和疾病分期,能更好预测患者预后。
  3.低叶酸可激活Hedgehog信号通路,增加Shh表达,影响SPP1,从而增加肿瘤细胞的致癌性。
  结论:
  1.临床流行病学可以从大样本获取与疾病相关的临床特征和特殊的诊断指标;
  2.生物信息学可以从患者基因的角度分析影响疾病的因素,为机制研究做铺垫;
  3.细胞学实验可以做为基础实验的一部分验证临床试验和生物信息学,为之后的临床提供理论依据。
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