农民专业合作社作为发展现代农业的重要组织保障，在提高农民组织化程度、有效对接“小农户”与“大市场”、增加农民收入及建设社会主义新农村等方面发挥了重要的作用。福建农民专业合作社经过多年发展，在数量规模及带动农户等方面取得了显著的成效，正日益成为引领农户参与市场竞争的现代农业经营组织，但各地区、各产业的农民专业合作社效益水平参差不齐，规范化程度各异。因此福建农民专业合作社的规范化发展依然任重道远，其功能作用有待进一步发挥。近年来，党中央、国务院及地方政府高度重视和支持农民专业合作社发展，福建农民专业合作社迎来了良好的发展契机。在“十二五”规划和发展现代农业、建设社会主义新农村的时代背景下，如何评价农民专业合作社运营绩效水平，探讨其发展中存在的缺陷与不足，并采取针对性强的政策措施加以改进成了摆在面前的重要问题。本研究以制度变迁理论、合作社理论及农业经济学理论等为主要分析工具，从规模、效益及影响力三个角度出发，构建适合福建实际的农民专业合作社运营绩效评价指标体系，并通过实证和规范分析探讨以上问题，不仅能够丰富已有研究成果，更重要的是能为福建农民专业合作社的健康可持续发展提供有益的政策建议和改进措施，从而提高政府扶持资金的导向性及使用效率，因而具有重要的理论和现实意义。本研究主要围绕以下六部分展开：第一部分是引言，包括提出问题，论述研究目的及意义，界定相关概念，阐述研究思路及方法；第二部分是国内外研究现状，主要对国内外已有研究成果进行综述，并进行简要述评；第三部分是福建农民专业合作社发展的现状特点，主要利用第一手数据资料对福建农民专业合作社发展的现状成效及存在的主要问题进行分析；第四部分是农民专业合作社运营绩效评价指标体系的构建，在阐述指标体系构建原则的基础上，文章结合已有学者研究，构建了一个包含三个二级指标、十个三级指标的评价指标体系；第五部分是福建农民专业合作社运营绩效评价的实证研究，这也是本文的主体部分，首先简要介绍了因子分析原理，说明了数据来源，并对样本数据进行描述性统计分析，其次利用因子分析法提取公因子，计算各公因子得分及综合得分并排序，最后采用聚类分析法进一步归类、分析和讨论；第六部分是研究的主要结论及对策建议，包括研究结论、相关对策建议及有待进一步研究的地方。